咖啡种质资源SSR指纹图谱构建及遗传多样性分析

咖啡种质分布范围广，通过长期的种质引进、自然杂交和人工杂交繁殖，形成了极其丰富的咖啡基因资源。但我国咖啡种质的研究较浅，仅对一些种质资源进行了生物学性状、农艺性状、品质性状的鉴定和评价研究，不同种质间的亲缘关系、种质的遗传多样性等方面的研究还未开展，阻碍了对种质的优良遗传性状的深度挖掘。长期的种质引进及生产管理中很容易出现品种同种异名、异名同种、品种名混淆和育成品种遗传基础不清的状况，阻碍了咖啡种质资源的共享利用研究。在进行品种推广过程种，易造成生产上种植的品种混乱，制约了咖啡生产的发展。.本项目拟利用SSR分子标记对我国现有咖啡种质资源和咖啡优良品种进行DNA指纹图谱构建并对咖啡种质资源进行遗传多样性分析，项目的完成将为生产上品种真实性和纯度鉴定、品种知识产权保护和优良品种推广提供技术支持，对我国咖啡的遗传改良、种质保护、核心种质的构建具有重要意义。

我国咖啡种质主要引自国外，由于种质引进过程中对国外种质遗传背景不了解，咖啡种质间亲缘关系远近、遗传差异大小等情况还不是十分清楚，加上引种途径混杂多样，容易出现种质同种异名、异名同种、种质混淆等情况，阻碍了对我国咖啡种质资源的创新利用。本研究利用152对SSR分子标记对国内收集保存的92份咖啡核心种质进行了遗传多样性分析，研究结果表明我国咖啡种质遗传基础比较狭窄，尤其是小粒种咖啡种质，种内平均遗传相关系数高达0.923；利用12对SSR引物构建了92份咖啡核心种质的指纹图谱，12对SSR引物共扩增出112条条带，平均每对引物9.3条。这为我国咖啡种质资源保护利用及种质鉴定提供了依据。