籼稻、粳稻结构差异基因的比较分析及功能鉴定

本项目计划利用籼稻广陆矮4的10,096条全长cDNA克隆和序列资源，对栽培稻两个亚种籼稻和粳稻的结构差异基因进行系统的序列分析及功能分类，建成一个籼、粳稻结构差异基因的公共数据库。然后通过cDNA芯片杂交的方法及实时定量PCR方法对基因的表达进行分析，研究籼、粳稻结构差异基因在籼稻、粳稻中的表达模式。综合生物信息学分析结果和基因表达分析的结果，筛选出10个籼稻、粳稻亚种变异保守基因。通过水稻的转化及突变体分析等手段，研究清楚1-2个籼、粳稻结构差异基因作用的分子机制及对水稻表型的影响。为在全长cDNA序列平台基础上，通过反向遗传学方法研究籼、粳稻结构差异基因的策略探索出一条可行性的途径。