人类基因间区长链非编码RNA功能性遗传多态在白塞氏病发生中的作用及其机制研究

基本信息
批准号:81770916
项目类别:面上项目
资助金额:54.00
负责人:漆剑
学科分类:
依托单位:重庆医科大学
批准年份:2017
结题年份:2021
起止时间:2018-01-01 - 2021-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:徐梅,苏冠男,叶子,刘姝林,钟元园,苏文成,易圣蓝,袁雯,袁刚祥
关键词:
长链非编码RNA全基因组关联分析研究葡萄膜炎单核苷酸多态白塞氏病
结项摘要

Bechet disease (BD) is a subtype of uveitis with high mobidity and the high rate of blindness in China. It has long been understood that certain infectious events and/or environmental factors may trigger Bechet disease in individuals with particular genetic variants. However,the precise genetic background for BD is not clear at present. We have found that a lot of the phenotype-related locis identified by genome-wide association studies (GWAS) of Bechet disease map to noncoding genome regions with unknown function.We rencently also found that the expression of LncRNA was abnormal expression in BD patients by microarray. We suspect that the functional variant of LncRNA may be involved in the pathogenesis of Behcet's disease. Using the technical methods such as Real-time PCR, FCM, ELISA, ChIP-Seq, our project aims to validate the association of the functional variant of LncRNA with the BD patients, to investigate the influence of the functional variant of LncRNA on the immune function of BD patients,to reveal the functional variant of LncRNA how to regulate the target gene and protein expression. Our study may offer a novel molecular biomarkers and therapeutic approach for BD patients.

白塞氏病是我国常见且重要的致盲性葡萄膜炎类型,遗传背景是其发生的重要因素,但确切遗传机制尚不清楚。我们采用全基因组关联分析和基因芯片技术发现大量与白塞氏病相关的单核苷酸多态位于非编码区且存在相应LncRNA异常表达,我们推测LncRNA功能性遗传多态可能参与了白塞氏病的发生,预实验结果初步证实了我们的推测。本项目将扩大样本量并采用质谱仪分析探讨LncRNA功能性遗传多态是否与白塞氏病发生有关,采用Real-time PCR、流式细胞术及基因转染等方法探讨LncRNA功能性遗传多态是否影响白塞氏病患者免疫功能,利用生物信息学预测、双荧光素酶报告及染色质免疫沉淀-深度测序等方法探讨LncRNA功能性遗传多态通过何种方式影响靶标基因和蛋白表达,旨在揭示LncRNA功能性遗传多态参与白塞氏病发生的可能机制。本研究将可能为以白塞氏病为代表的葡萄膜炎防治研究提供新的生物学标记和干预靶点。

项目摘要

白塞氏病是我国常见且重要的致盲性葡萄膜炎类型。长链非编码RNA在免疫介导疾病的发生发展过程中发挥着重要作用,但其在白塞氏病发生中发挥何种作用目前尚不完全清楚。本项目旨在探讨长链非编码RNA相关的功能性遗传多态与中国汉族人群白塞氏病患者遗传易感性之间的关系。本项目采用两阶段病例对照关联分析,纳入1132例白塞氏病患者及1132例正常对照,采用MassARRAY质谱分析,发现rs7130280与白塞氏病的发生呈负性相关(OR=0.72, Pc=1.15×10-6)。同时,我们采用real-time PCR、流式细胞术、CCK-8及western blot等技术方法,定量分析了lncRNA-miRNA-mRNA的分子轴表达及rs7130280的功能作用。我们的研究发现SNP rs7130280可能通过影响长链非编码RNA NONHSAT159216.1的二级结构和表达从而发挥其免疫调控作用,过表达rs7130280 A 等位基因可以显著抑制细胞增殖水平。同时我们还发现rs7130280 A 等位基因可以抑制miR-6778-5p的表达水平,并通过ceRNA作用机制从而增强其下游靶标分子RPS6KA4/IL10的表达。综上,本项目初步证明了rs7130280可能通过lncRNA-miRNA-mRNA免疫调控网络参与了白塞氏病的发生,对其致病发挥抑制保护作用。本研究将可能为以白塞氏病为代表的葡萄膜炎防治研究提供新的生物学标记和干预靶点。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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