运用AMX600核磁共振谱仪测定了BmKI在重水和水中不同温度及pH条件下的DQF-COSY,TOCSY,NOESY等谱,分析2D-NMR数据完成了各类残基质子自旋系统的识别和质子共振信号的序列归属,根据其特征NOE相关键模式以及慢交换酰胺质子的序列位置决定了其氢键分布和特征二级结构,采用可变目标函数(DIANA程序)进行距离几何计算,得到一组BmKI的初始三维结构模型,运用质子间距离,氢键以及二硫键等作为约束条件.采用由能量优化,约束分子动力学模拟和模拟退火计算等组成的复合步骤对初始结构进行结构精修,得到一组BMKI分子的溶液优势构象,其主要结构特征包括一个三股反平行的β折叠,一段α螺旋,四个β-转角,β折迭与α螺旋呈平行排列,残基Tyr(5),Tyr(35)和Trp(47)的芳环彼此呈正交排列,并构成蛋白表面的疏水区域.
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数据更新时间:2023-05-31
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