解吉为藏医治疗赤巴病的传统首选药物之一,品种来源涉及龙胆科龙胆属多种植物,一直较为复杂,经典方法进行鉴定有其局限性。本研究拟与西藏藏医学院的藏医药专家合作,采用民族植物学、植物分类学及分子生物学等多学科原理及DNA条形码技术,对常用藏药解吉进行系统的品种整理,基源植物的传统分类学及基因鉴定研究,构建适合解吉多来源特点的DNA条形码识别系统,并评价该条形码在解吉药材鉴定中的意义,以期为藏药的民族植物学研究与品种的快速、准确鉴定提供新思路与新方法。
藏药解吉为多来源品种,基原植物涉及龙胆科龙胆属Gentiana秦艽组(Sect. Cruciata)多种植物,经典方法进行物种鉴定有其局限性。本项目在解吉品种整理、植物分类学研究基础上,应用分子生物学方法,确定各物种DNA条形码。.在西藏,甘肃及云南等省区进行野外考察、标本采集。鉴定出该组解吉基原植物9种:麻花艽Gentiana straminea,粗壮秦艽G. robusta,小秦艽G. dahurica,粗茎秦艽G. crassicaulis,西藏秦艽G. tibetica,长梗秦艽G. waltonii,管花秦艽G. siphonantha,黄管秦艽G. officinalis及全萼秦艽G. lhassica;另一种为秦艽G. macrophylla。此工作为深入开展条形码研究打下坚实基础。.测定核基因组ITS区,叶绿体基因组matK、rbcL、rpoC1、trnL(UAA) intron、psbA-trnH、atpB-rbcL、trnS(GCU)-trnG(UCC)、rpl20-rps12、trnL(UAA)-trnF(GAA),线粒体nad1第2内含子,nad5第4内含子片段,评价各片段或片段组合的物种鉴定意义。筛选结果显示:叶绿体基因组rpoC1和trnL(UAA) intron,线粒体基因组nad5第4内含子在秦艽组植物中的鉴定意义有限,而其他均可作为相关物种的条形码推荐序列。.获得粗壮秦艽,粗茎秦艽,西藏秦艽及麻花艽4种及1外类群玄参科植物齿叶玄参Scrophularia dentata的叶绿体全基因组序列。该工作可为进一步特异性鉴定引物的筛选及优化条形码片段组合提供基础资料。.以遗传背景丰富多样的粗壮秦艽为切入点,根据形态学及分子证据,推断其为一自然杂交种,麻花艽可能为该物种的母系来源;进而构建杂交物种粗壮秦艽的条形码。该工作可为探讨杂交物种的形成机制及中药材道地性研究等工作打下坚实基础。.鉴于一些物种特定DNA片段在基因组内存在明显多样性特点,采用基因分型方法及数理统计学原理进行鉴定相关物种的方法学研究,取得有效鉴定结果。.构建国产秦艽组10种植物的DNA条形码。.本工作可为藏药解吉的基原植物鉴定,多样本、多基因组、多片段遗传多样性分析,物种就地保护及龙胆科系统学研究等提供基础资料;并为遗传背景复杂多样的药用植物鉴定研究提供借鉴与参考。
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数据更新时间:2023-05-31
DNAgenie: accurate prediction of DNA-type-specific binding residues in protein sequences
神经退行性疾病发病机制的研究进展
MK-FSVM-SVDD: A Multiple Kernel-based Fuzzy SVM Model for Predicting DNA-binding Proteins via Support Vector Data Description
A label-free fluorescent probe for accurate mitochondrial G-quadruplex structures tracking via assembly hindered rotation induced emission
DNA methylation level of promoter region of activating transcription factor 5 in glioma
多基源藏药蒂达的质量等同性研究及其DNA条形码识别系统的构建
基于叶绿体基因组的藏药“解吉”DNA分子鉴定研究
多基源民族药岩陀DNA条形码识别系统构建
中国重楼属药用植物DNA条形码研究及其分类整理