microRNA在果梅雌蕊败育中的调控作用

基本信息
批准号:31101526
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:24.00
负责人:高志红
学科分类:
依托单位:南京农业大学
批准年份:2011
结题年份:2014
起止时间:2012-01-01 - 2014-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:乔玉山,蔡斌华,王飞,侍婷,罗晓燕
关键词:
雌蕊败育果梅microRNA
结项摘要

本研究结合项目组多年果梅种质资源和分子生物学的研究基础,在采用石蜡切片找出雌蕊败育关键时期的基础上,拟通过高通量测序分离与果梅雌蕊败育相关的microRNAs,预测其靶基因并通过荧光定量PCR、RLM-RACE以及转基因进行表达分析和功能鉴定,初步筛选出与雌蕊败育相关的关键microRNAs,然后利用原位杂交技术等对上述关键microRNAs进行细胞定位及其对AGAMOUS等雌蕊调控基因表达的影响,鉴定出果梅雌蕊败育的关键microRNAs,初步明确microRNA在果梅雌蕊选择性败育中作用,为揭示果梅雌蕊败育的分子机制提供依据。

项目摘要

通过构建果梅完全花和不完全花的小分子RNA文库,我们从这两个文库中分别获得了22561972和24952690条序列。鉴定了属于24个家族的61个已知miRNAs,其中7个在完全花和不完全花中表达差异明显。此外,根据测序文库中成熟miRNAs和miRNA*s的存在,我们鉴定了61个潜在的新的miRNA,其中6个在完全花和不完全花中表达差异明显。这13个差异表达miRNAs的靶基因预测中共得到212个靶基因,GO注释发现这些基因主要存在于发育调控、转录调控以及胁迫反应中。这13个miRNAs中,共有9个在完全花和不完全花中差异表达高达3倍以上,此外,10个miRNAs表现为抑制雌蕊发育,剩下3个表现为促进雌蕊发育。在6个差异表达的新的miRNAs中,miR6274和miR482c为完全花中特有,而miR6295,miR171d和miR319b为不完全花特有。其中,miR319,miR319a,miR319e,miR160,miR393,miR394,miR6274,miR6295和miR171d预测的靶基因为转录因子或F-box蛋白;miR319/miR319a/miR319e预测的靶基因为ARF2,miR160a的靶基因为ARF16/17,这些靶基因均在花发育中起着重要的作用,进一步为果梅雌蕊发育相关的miRNAs提供了信息学及实验方面的信息。本研究还利用荧光定量PCR技术研究了miR319等与其靶基因之间的调控关系,进一步明确了miR319、miR6295、miR171d和miR319b等在果梅雌蕊发育中具有重要的作用。获得了果梅花器官microRNA的表达谱,发现了61个新的果梅microRNA,其中13个与果梅雌蕊发育相关的关键microRNAs; 初步明确了miR6295,miR171d,miR319b,miR6274,miR482c等在果梅雌蕊发育中具有重要调控作用;在核心期刊上发表基金标注论文16篇,其中SCI论文13篇;培养研究生3名,其中1名为博士研究生。

项目成果
{{index+1}}

{{i.achievement_title}}

{{i.achievement_title}}

DOI:{{i.doi}}
发表时间:{{i.publish_year}}

暂无此项成果

数据更新时间:2023-05-31

其他相关文献

1

青藏高原狮泉河-拉果错-永珠-嘉黎蛇绿混杂岩带时空结构与构造演化

青藏高原狮泉河-拉果错-永珠-嘉黎蛇绿混杂岩带时空结构与构造演化

DOI:10.3799/dqkx.2020.083
发表时间:2020
2

Ordinal space projection learning via neighbor classes representation

Ordinal space projection learning via neighbor classes representation

DOI:https://doi.org/10.1016/j.cviu.2018.06.003
发表时间:2018
3

基于纳米铝颗粒改性合成稳定的JP-10基纳米流体燃料

基于纳米铝颗粒改性合成稳定的JP-10基纳米流体燃料

DOI:
发表时间:2021
4

蒙古冰草抗旱相关amo-miR5靶基因预测及表达载体构建

蒙古冰草抗旱相关amo-miR5靶基因预测及表达载体构建

DOI:
发表时间:2017
5

Image super-resolution based on sparse coding with multi-class dictionaries

Image super-resolution based on sparse coding with multi-class dictionaries

DOI:doi: 10.31577/cai 2019 6 1301
发表时间:2019

高志红的其他基金

相似国自然基金

1

miR319a/PmTCP15在果梅雌蕊花柱败育中的协同调控研究

批准号:31772282
批准年份:2017
负责人:高志红
学科分类:C1503
资助金额:60.00
项目类别:面上项目
2

三倍体罗汉果种子败育分子机理研究

批准号:81860678
批准年份:2018
负责人:韦荣昌
学科分类:H3201
资助金额:35.00
项目类别:地区科学基金项目
3

miR156在弱光诱导荷花花芽败育中的调控机理研究

批准号:31772346
批准年份:2017
负责人:徐迎春
学科分类:C1507
资助金额:60.00
项目类别:面上项目
4

AG-WUS-PcG-lncRNA互作对梅多雌蕊发育的调控

批准号:31500571
批准年份:2015
负责人:侍婷
学科分类:C1612
资助金额:20.00
项目类别:青年科学基金项目