EBV膜蛋白LMP2A/2B的CD8+ CTL表位的筛选、鉴定及应用基础研究

基本信息
批准号:81902050
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:20.00
负责人:李江平
学科分类:
依托单位:四川大学
批准年份:2019
结题年份:2022
起止时间:2020-01-01 - 2022-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:
关键词:
鼻咽癌免疫细胞治疗疫苗EBV抗原表位
结项摘要

EBV (Epstein-Barr virus) shows clonal amplification in nasopharyngeal carcinoma (NPC) cells, which is a type II latent infection mode and mainly expresses viral latent membrane proteins. In previous studies, we predicted and screened the candidate virus antigen LMP2A/2B encoded by EBV gene in NPC through single-cell sequencing and bio-information technology, which was highly expressed in almost all carcinoma cells and involved in the transformation, occurrence and development of NPC. However, the screening, identification and application of specific epitopes of LMP2A/2B virus antigen in NPC remain unclear. In this study, we systematically intend to screen and identify the HLA-I type restricted associated CD8+ CTL epitopes from the LMP2A/2B. And then using tetramer staining, we identify T cells specifcally recognizing LMP2A/2B epitopes from PBMCs and clone the T cell receptor (TCR) α and β chains using a single-cell cloning technique. By expressing the paired TCRα/β genes in human primary T cells, we generate TCR-T cells for verification of the specificity and affinity of epitopes. Finally, we carry out the animal experiments to verify and discuss its killing effects and mechanisms. Therefore, the screening and identification of EBV-specific antigen epitopes and the design of TCR-T have profound significance for the research on how to identify, prevent and treat NPC associated with EBV infection, and provide sufficient scientific basis for the subsequent research and development of new vaccines.

EBV在鼻咽癌细胞中呈克隆性扩增,为II型潜伏感染模式,主要表达病毒潜伏膜蛋白。我们前期通过单细胞测序和生物信息技术,预测和筛选得到鼻咽癌中EBV基因编码的候选病毒抗原LMP2A/2B,几乎在所有癌细胞中高表达,并参与鼻咽癌的转化、发生及发展等。但对鼻咽癌中LMP2A/2B抗原的特异性表位的筛选、鉴定及应用仍不清楚。本研究拟系统地筛选并鉴定出LMP2A/2B抗原的HLA-I型限制性相关的CD8+ CTL表位,使用四聚体染色技术,分选出表位肽特异性T细胞,并使用单细胞测序技术克隆出TCRα和β链,然后构建稳定表达TCRα/β的PBMCs,用于反验证表位肽的特异性和亲和力,继而进行动物实验以验证和探讨其杀伤作用和机制。因此,对于这种EBV特异性抗原表位的筛选、鉴定及TCR-T的设计,对于研究如何识别、预防和治疗相关于EBV感染的鼻咽癌意义深刻,并为后续新型疫苗的研发等提供充分的科学依据。

项目摘要

EBV在鼻咽癌细胞中呈克隆性扩增,为II型潜伏感染模式,主要表达病毒潜伏膜蛋白。我们前期通过单细胞测序和生物信息技术,预测和筛选得到鼻咽癌中EBV基因编码的候选病毒抗原LMP2A/2B,几乎在所有癌细胞中高表达,并参与鼻咽癌的转化、发生及发展等。但对鼻咽癌中LMP2A/2B抗原的特异性表位的筛选、鉴定及应用仍不清楚。本研究拟系统地筛选并鉴定出LMP2A/2B抗原的HLA-I型限制性相关的CD8+ CTL表位,使用四聚体染色技术,分选出表位肽特异性T细胞,并使用单细胞测序技术克隆出TCRα和β链,然后构建稳定表达TCRα/β的PBMCs,用于反验证表位肽的特异性和亲和力,继而进行动物实验以验证和探讨其杀伤作用和机制。我们收集并对鼻咽癌患者HLA-I-A、B、C亚型分型检测,收集鼻咽癌肿瘤组织进行单细胞转录组分析鼻咽癌肿瘤组织的免疫微环境和分析EBV阳性鼻咽癌肿瘤细胞和EBV感染之间的作用。设计并合成了EBV 阳性鼻咽癌特异肿瘤新抗原 LMP1、 LMP2A 和 LMP2B 重叠片段,建立并培养永生化 B 淋巴母细胞系(LCLs) 的转化及 LMP1、 LMP2A 和LMP2B 潜伏蛋白的表达,ELISA实验验证了EBV 阳性鼻咽癌中特异肿瘤新抗原 LMPs 的特异性免疫应答,同时ELISPOT筛选了EBV 阳性鼻咽癌特异肿瘤新抗原 LMP1、 LMP2A 和 LMP2B 分别具有多个针对抗原特异性 EBV-CD8+ CTLs 的抗原表位,继续截断筛选 EBV 阳性鼻咽癌特异肿瘤新抗原 LMP1、 LMP2A 和LMP2B 里针对抗原特异性 EBV-CD8+ CTLs 的真正抗原表位。最后流式细胞术联合四聚体检测 EBV 阳性鼻咽癌特异肿瘤新抗原LMP1、 LMP2A 和 LMP2B 抗原表位肽特异性 T 细胞,建立 EBV 阳性肿瘤的小鼠肿瘤模型及抗原特异性T细胞的体内杀伤实验等。因此,对于这种EBV特异性抗原表位的筛选、鉴定及TCR-T的设计,对于研究如何识别、预防和治疗相关于EBV感染的鼻咽癌意义深刻,并为后续新型疫苗的研发等提供充分的科学依据。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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