基于RAD-Seq技术的青稞高密度遗传图谱构建及重要农艺性状QTL定位

Hulless barley, grown in Qinghai-Tibetan Plateau, was the important genetic resources for crop breeding. It is very important to construct the high-density linkage map, which provides basic information for fine mapping and gene cloning, which was also important significance for marker assisted selection breeding and functional genome research.In this study, SSR framework genetic map and SNP+ SSR high-density genetic integrated map were constructed in our project group by using RIL population from a cross between barley "Dulihuang" and "Kunlun 12", some agronomic traits, including morphological traits of flag leaf, stem height, tiller number, productive tiller number, number of grains per main spike, 1000-grain weight, were analyses for QTL mapping in the RIL population.

青稞，种植于青藏高原高寒地区，是作物改良的重要遗传资源。青稞遗传图谱的构建，既是优异基因QTL定位及克隆的基础，也为青稞重要农艺性状的精细定位和基因克隆奠定基，同时有助于促进青稞的分子辅助育种和基因组学研究。本项目利用两个农艺性状差异显著的青稞优良农家品种“肚里黄”（穗抽不出旗叶叶鞘分孽力强，成穗率高）和昆仑12号亲本以及其RIL 群体为研究对象，采用RAD-seq 测序技术策略，对基因组进行高深度测序开发大量的 SNP 标记，进而构建青稞遗传连锁图谱，结合这个群体的 SSR标记整合成一张高密度遗传整合图谱。与此同时，对“肚里黄”和昆仑12号亲本以及其RIL 群体重要农艺性状，即旗叶抽出与半抽出、株高、分蘖数、有效分蘖、穗粒数及千粒重等农艺性状进行测定，进行青稞农艺性状相关基因的QTL 分析。

青稞，是青藏高原重要的农作物。通过青稞遗传图谱的构建，将为优异基因QTL定位及克隆奠定基础基础，也为青稞重要农艺性状的精细定位和基因克隆提供基础信息。本项目以青稞优良农家品种“肚里黄”和昆仑12号亲本以及其RIL 群体为研究对象，通过基因组重测序对基因组进行高深度测序开发大量的SNP标记，构建出青稞遗传连锁图谱。与此同时，对“肚里黄”和昆仑12号亲本以及其RIL群体重要农艺性状，即株高、穗长、单株穗数、穗粒数及穗粒重等农艺性状进行测定，进行青稞农艺性状相关基因的进行分子标记。通过研究表明，7个连锁群包含1202个分子标记，遗传总距离1196.2cM。并对穗长和穗粒重2个农艺性状关联的分子标记进行了遗传图定位，其中在4号染色体的Qk5515a和Qk5522c区间和6号染色体的Qk6021a和Qk6022b的区间分别为穗长和穗粒重关联。这两个分子标记将为后续分子标记育种提供重要依据。