肠道微生物群落的结构动力学与功能解析研究

肠道菌群是自然界最为复杂和最为重要的微生物群落类型之一，解析其结构和功能的关系是国际学科前沿课题，对人体健康也意义重大。本项目拟以高脂饮食＋STZ诱导的实验性2型糖尿病大鼠为模式系统，利用针对16S rRNA 基因的PCR-DGGE、T-RFLP指纹图技术和高通量短标签测序技术，对糖尿病大鼠、造模抵抗大鼠和健康对照肠道菌群进行动态监测及动力学研究，结合生理生化指标测定，利用多变量相关分析，对比大鼠肠道菌群结构的特征性差异，寻找与疾病直接相关的肠道菌群分子分类标记，并以此引导对可培养的功能菌类群的分离和功能验证；同时，对筛选出的典型个体的肠道元基因组用454技术进行大规模测序、拼接和基因预测，发现生境专一性基因类型。从而建立通过群落结构和功能动力学变化分析，来鉴定参与疾病发生发展过程的重要肠道功能菌和功能基因的技术方法，力求深入理解宿主与菌群的互作机制，并为人类元基因组研究开拓新的技术路线。