基于核小体动态水平研究解毒祛瘀滋肾方治疗系统性红斑狼疮的转录调控机制

系统性红斑狼疮（SLE）一种累及多器官系统的自身免疫性疾病，对人体的危害性极大。临床研究发现，解毒祛瘀滋肾法治疗SLE，疗效显著，但是其治疗作用的分子生物学机制还不清楚？近期研究表明组蛋白3第4位赖氨酸二甲基化（H3K4me2）可以在基因组水平，较好地标记受到外界刺激后核小体定位动态变化：核小体移位暴露的H3K4me2标记的DNA片段，可供转录因子结合，调控基因表达。因此，本研究拟采用染色质免疫沉淀-高通量测序（ChIP-seq）技术，分析解毒祛瘀滋肾治疗的SLE患者外周血单核细胞H3K4me2，运用生物信息学方法归类分析结果，从H3K4me2的分布分析核小体定位，推测验证与解毒祛瘀滋肾相关的基因转录调控位点及可能结合的转录因子位置与种类，探讨SLE解毒祛瘀滋肾法治疗机制。

系统性红斑狼疮（SLE）是一种累及多器官系统的自身免疫性疾病。我们前期研究表明解毒祛瘀滋肾方是从多靶点、多方位、多层次对机体进行综合调节而发挥作用。因此，本研究采用染色质免疫沉淀-高通量测序（ChIP-seq）技术，在基因组整体范围内，分析解毒祛瘀滋肾方治疗的SLE患者外周血单核细胞H3K4me2标记的核小体动态变化，运用生物信息学方法归类分析结果，得到中药方剂治疗后染色体开放区域（open chromatin）的变化及这类区域附近的基因，并推断变化区域可能结合的转录因子，从而得到中药治疗的具体作用机制与通路。项目进展受限的原因主要是目前数据库中无PBMCs的H3K4me2 ChIP-seq数据。因此，我们以PBMCs的主要细胞成分B或者T细胞搜索，获得相关数据；并寻找这些数据共有的且信号较强的H3K4me2区域，作为qPCR验证区域；然后选取结果较好的，进行高通量测序分析。.项目目前正在进行高通量测序分析，已投稿1篇文章，1篇综述。