优质超细毛羊毛性状相关lncRNA的鉴定及其调控作用的解析

Long non-coding RNA (lncRNA) is a kind of RNA molecules whose transcription length are more than 200nt without coding proteins, which have made progress in terms of certain human diseases, but studies on lncRNA function have never been reported about wool fiber forming in sheep.In view of sheep breeding status quo in China, this project intended to make superfine-wool sheep from xinjiang as the experimental animals, using a new generation of sequencing technology, bioinformatics method, fluorescence quantitative and matrix assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF-MS) techniques to study on lncRNA in hair follicle development of different embryonic periods, then determine the lncRNA sequences, and analyze structrual pattern, function and genetic effect of some important lncRNA and their target genes, selectively. Therefore, the lncRNA transcript expression regulation in hair follicle development of different embryonic periods and their target genes genetic variation will be revealed. Through the project implementation, molecular genetic mechanism of lncRNA and target genes in hair follicle development and main economic traits formation in super fine wool sheep will be studyed to fill the blank about domestic and foreign lncRNA research and provide novel scientific materials for molecular breeding and directional selection in superfine-wool sheep.

长链非编码RNA（lncRNA）是一类转录本长度超过200nt的不编码蛋白质RNA分子，在与人类特定疾病有关方面已取得了进展，但是在绵羊羊毛纤维形成中lncRNA的功能研究并未见报道。因此，针对我国绵羊育种现状，本研究拟以新疆优质超细毛羊为试验动物，利用新一代测序技术、生物信息学方法、荧光定量技术以及飞行时间质谱技术等手段开展对胚胎期毛囊发育过程中不同时期的lncRNA研究，确定其lncRNA基因序列，并选择性地研究若干重要lncRNA及其靶基因结构模式和功能及其遗传效应,从而分析超细毛羊毛囊发育不同阶段lncRNA转录本的表达调控和靶基因遗传变异。通过项目实施，进一步揭示影响超细毛羊毛囊发育和主要经济性状形成的lncRNA及其靶基因分子遗传机制，填补国内外超细毛羊lncRNA领域研究的空白，为细毛羊分子育种与定向选育提供新的科学资料。

长链非编码 RNA（lncRNA）是一类转录本长度超过 200nt 的不编码蛋白质 RNA分子，在与人类特定疾病有关方面已取得了进展，但是在绵羊羊毛纤维形成中 lncRNA 的功能研究并未见报道。因此， 针对我国绵羊育种现状， 本研究拟以新疆优质超细毛羊为试验动物， 利用新一代测序技术、生物信息学方法、 荧光定量技术以及飞行时间质谱技术等手段开展对胚胎期毛囊发育过程中不同时期的 lncRNA 研究，确定其 lncRNA 基因序列，并选择性地研究若干重要 lncRNA及其靶基因结构模式和功能及其遗传效应,从而分析超细毛羊毛囊发育不同阶段 lncRNA 转录本的表达调控和靶基因遗传变异。通过对本课题的实施完成对新疆巩乃斯种羊场16个毛用性状进行遗传参数和育种值估计值；获得在毛囊发育6个不同时期中共检测到471个差异表达的LncRNA；通过对差异LncRNA进行靶基因预测发现，共有3687 顺式作用的靶基因以及1722反式作用的靶基因；功能富集分析发现， 471个差异LncRNA靶基因富集到5509个Go term以及268个Pathway中；筛选出超细型和细型细毛羊皮肤组织中差异表达基因24个；培养研究生6名；在SCI国际源期刊杂志发表论文2篇，核心期刊发表论文11篇；获得实用新型专利申请13项，软件著作权1项，地方标准颁布4项。通过项目实施，进一步揭示影响超细毛羊毛囊发育和主要经济性状形成的 lncRNA 及其靶基因分子遗传机制，填补国内外超细毛羊 lncRNA 领域研究的空白，为细毛羊分子育种与定向选育提供新的科学资料。