甘蓝型油菜每角粒数主效QTL精细定位和侯选基因鉴定

油菜每角粒数遗传力高且对产量有很大贡献。利用在每角粒数上有极显著差异的油菜测序品种构建的分离群体,我们在A6染色体定位到一个稳定控制每角粒数的呈完全显性模式遗传的新主效QTL，其LOD值和贡献率都超过已往报道。以该主效QTL为目标，本项目利用连续回交结合分子标记辅助选择构建杂合QTL-NIL，并自交获得QTL-NIL分离群体；田间种植该群体，利用生物信息学方法在目标QTL区间逐步加密分子标记并对其进行基因型分析寻找交换单株，结合其每角果粒数的表型数据，将目标QTL逐步精细定位到100kb左右的标记区间内。最后，对QTL对应的精细物理图谱进行基因预测、注释和分类及亲本间SNP分析，确定2-3个候选基因。研究结果可用于分子标记辅助选择育种，也可为基因功能验证和油菜每角粒数及其杂种优势调控的分子机理研究奠定基础。利用QTL-NIL精细定位的方法可为油菜其它数量性状基因精细定位提供借鉴和参考。

为了精细定位目标主效QTL，我们利用其置信区间内开发的6个高质量共显性分子标记对5047个BC4F2单株进行基因型分析筛选重组单株。在成熟期，我们收获了重组单株并对其进行每角粒数的考种。我们通过比较10种不同类型重组单株和轮回亲本中双11在每角粒数上的差异，将目标主效QTL进一步锁定到标记BrSF47-10和BrSF46-167之间。该标记区间对应白菜物理图谱329 kb，含62个注释基因。最后，我们通过生物信息学分析确定了目标主效QTL区间内的两个侯选基因。