大坝阻隔对钱塘江水系日本沼虾群体遗传结构和遗传多样性的动态影响

日本沼虾是我国重要的淡水经济养殖虾类，钱塘江水系是其重要野生资源分布地之一。1950年代，新安江水电站、富春江水电站的相继建成并截流，将钱塘江水系自上而下分成了三个江段，形成了四种不同的生态类型。本研究在2007、2009、2011和2013年4个不同年度内调查和收集钱塘江水系日本沼虾野生群体种质资源的基础上，分别从线粒体基因和核基因组水平，采用线粒体COI片段序列变异测定法、荧光标记多重PCR微卫星技术以及毛细管电泳分离技术，分析研究坝址上下日本沼虾群体间基因交流状况、不同江段间和库区间日本沼虾群体间遗传漂变、基因流和种群异质性，以及4个年度内钱塘江水系日本沼虾遗传结构和遗传多样性的时间、空间动态变化规律，以探索大坝阻隔对钱塘江水系日本沼虾遗传结构和遗传多样性的动态变化的影响，为钱塘江水系日本沼虾的种质资源保护和优异种质挖掘和创新利用提供科学参考。

研究通过磁珠富集法和转录组测序法共分离筛选SSR标记6800个，并随机选取24个多态性较好的引物，构建了多重PCR技术，并测定了日本沼虾线粒体全基因组序列。采集了钱塘江三个江段不同年份22个水域的野生日本沼虾共38个样本，利用构建的微卫星多重标记技术和线粒体COI片段序列变异测定技术，分析了钱塘江水系日本沼虾的遗传结构的动态变化规律。结果显示，大坝建设将钱塘江水系日本沼虾显著分为三个族群，即富春江族群、新安江族群和钱塘江下游族群，但遗传分化程度不显著，遗传变异主要来源于群体内个体间，富春江段日本沼虾的遗传多样性高于新安江段和钱塘江下游段，钱塘江水系日本沼虾的6年内遗传结构稳定，没有发生瓶颈效应，种群数量没有显著下降。研究结果为钱塘江水系日本沼虾种质资源保护和开发利用提供了科学参考。