新型隐球菌毒力基因进化分析及新型抗隐球菌药物的前期开发

基本信息
批准号:31060006
项目类别:地区科学基金项目
资助金额:25.00
负责人:康颖倩
学科分类:
依托单位:贵州医科大学
批准年份:2010
结题年份:2013
起止时间:2011-01-01 - 2013-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:蒋燕萍,朱键,王梅竹,王丹霓,赵亮,刘莹
关键词:
基因敲除微卫星DNA毒力基因新型隐球菌
结项摘要

新型隐球菌感染是AIDS患者的一种机会性感染,已成为AIDS患者死亡的主要原因之一,目前尚无非常有效的治疗方法。近期本课题组研究人员在从巴西分离的新生隐球菌格鲁比变种环境株及临床株的微卫星基因分型鉴定中,发现临床株主要基因型MLMT13型与环境株主要基因型MLMT36型有明显的毒力差异,在国际上首次揭示了该菌微卫星基因型与毒力差异之间的相关性,由此提出关于新型隐球菌在环境与宿主之间传播过程中的基因型演变及毒力进化的假说。本项目借鉴当今关于新型隐球菌毒力因子研究建立的比较完善的相关基因库数据及功能分析,确定引起环境株和临床株主要微卫星基因型之间的毒力演变的关联基因,进一步研究新型隐球菌格鲁比变种在我国和世界其它地区的环境与宿主传播过程中毒力强弱的分布特点和相关毒力基因功能,为今后建立在细胞水平的抗隐球菌药物筛选分析方法提供重要依据,同时探讨如何采用有效方法防止隐球菌病的发生和传播。

项目摘要

新生隐球菌感染是AIDS患者的一种机会性感染,已成为AIDS患者死亡的主要原因之一,目前尚无非常有效的治疗方法。本课题组研究人员在从巴西分离的新生隐球菌格鲁比变种环境株及临床株的微卫星基因分型鉴定中,发现临床株主要基因型MLMT13型与环境株主要基因型MLMT36型有明显的毒力差异,在国际上首次揭示了该菌微卫星基因型与毒力差异之间的相关性,由此提出关于新生隐球菌在环境与宿主之间传播过程中的基因型演变及毒力进化的假说。根据预先制定的项目内容,我们基本按照预期计划进行了新生隐球菌的收集,分离鉴定和微卫星分型工作,并通过对新生隐球菌格鲁比变种在环境与宿主间传播中的毒力差异基因,探讨研究其在传播过程中毒力强弱的分布特点和相关毒力基因作用。我们先根据已发表文献的相关资料,选择部分可能的毒力基因进行分析,发现了一些影响毒力差异的相关毒力基因,然后通过全基因组重测序的方法进行了全面的差异基因分析研究工作。通过派遣研究生到合作外方学习和进一步的实验研究,对其中数个基因进行转录序列的结构分析和氨基酸序列的预测,构建了差异基因的突变株并从多方面验证其毒力变化,发现了有意义的差异基因,为进一步研究其基因功能和作用机制奠定了基础。同时在本研究过程中,我们还收集到了新的隐球菌菌种菌株,通过各种实验证实和撰写了隐球菌新种的论文。在对于其它酵母菌微卫星基因型的相关研究中,我们也发现了非常有价值的研究成果,证明微卫星基因型分类的方法不仅可以有助于研究酵母菌的地域分布及来源特点,并且较其他基因分类方法能够更为精细地展示和描述酵母菌来源、毒力与相关微卫星基因型之间的关系。通过动物实验研究发现白念珠菌的肺癌相关微卫星基因型菌株与肿瘤的形成之间存在一定相关性。本项目目前圆满完成了各项课题考核指标,通过该项目的启动,得到日方在研究资金,实验试剂、技术指导、菌种资源、数据信息、人才培养等多方面的大力支持。其中由日方为本课题组培养的两名中方博士生现已顺利毕业;资助中方人员在日培训和课题研究的生活补助;赠送我方研究相关菌株一百多株;协助中方进行基因组数据分析、基因敲除和验证等实验研究;来华支持我方在筑举办的学术培训班等等。本项研究无论从项目的完成度、取得的成果方面,还是在争取到的外方支持度方面,都较好地完成了国家自然科学基金项目的各项要求。

项目成果
{{index+1}}

{{i.achievement_title}}

{{i.achievement_title}}

DOI:{{i.doi}}
发表时间:{{i.publish_year}}

暂无此项成果

数据更新时间:2023-05-31

其他相关文献

1

DNAgenie: accurate prediction of DNA-type-specific binding residues in protein sequences

DNAgenie: accurate prediction of DNA-type-specific binding residues in protein sequences

DOI:10.1093/bib/bbab336
发表时间:2021
2

神经退行性疾病发病机制的研究进展

神经退行性疾病发病机制的研究进展

DOI:
发表时间:2018
3

猪链球菌生物被膜形成的耐药机制

猪链球菌生物被膜形成的耐药机制

DOI:10.13343/j.cnki.wsxb.20200479
发表时间:2021
4

长链基因间非编码RNA 00681竞争性结合miR-16促进黑素瘤细胞侵袭和迁移

长链基因间非编码RNA 00681竞争性结合miR-16促进黑素瘤细胞侵袭和迁移

DOI:
发表时间:2021
5

MK-FSVM-SVDD: A Multiple Kernel-based Fuzzy SVM Model for Predicting DNA-binding Proteins via Support Vector Data Description

MK-FSVM-SVDD: A Multiple Kernel-based Fuzzy SVM Model for Predicting DNA-binding Proteins via Support Vector Data Description

DOI:10.2174/1574893615999200607173829
发表时间:2021

相似国自然基金

1

新型隐球菌基因库的构建及rDNA物理图谱分析

批准号:39170046
批准年份:1991
负责人:廖万清
学科分类:C0109
资助金额:3.00
项目类别:面上项目
2

新型隐球菌毒性基因的分离及其致病性研究

批准号:39570043
批准年份:1995
负责人:廖万清
学科分类:C0109
资助金额:8.00
项目类别:面上项目
3

新型隐球菌饥饿应答缺陷抑制突变体的筛选及目标抑制基因的功能分析

批准号:31070125
批准年份:2010
负责人:刘晓光
学科分类:C0109
资助金额:30.00
项目类别:面上项目
4

新型隐球菌的分子生物学分类研究

批准号:39770002
批准年份:1997
负责人:吴建华
学科分类:C0101
资助金额:12.00
项目类别:面上项目