云南省结核分枝杆菌基因多态性与耐药性研究

Tuberculosis (TB) is a word-wide infectious disease which pathogen refers to Mycobacterium tuberculosis(MTB). Drug-resistance tuberculosis, especially, the multi-drug-resistant tuberculosis (MDR-TB) is the critical and difficult field in prevention and cure of TB. The present study shows that there are apparent regional differences in the genotype distribution of MTB. Yunnan as a multi-ethnic frontier province, has an unique geographical features and ethnic distribution with a severe TB epidemic. The study on the TB genotyping and relationship with drug resistance patterns in Yunnan is very important to the control of TB and the understanding of genotype distribution polymorphism in ethnic regions. This study intends to use multiple loci VNTR analysis (MLVA) and Spoligotyping method for genotyping the MTB which isolates from smear-positive TB patients who comes from 32 drug- susceptibility monitoring counties to find out the genotype polymorphism of TB. The detection of drug susceptibility and drug-resistant gene scanning plans to be carried out at the same time to understand the gene mutations of drug-resistant TB. Further explore the relationship among genotype, drug resistance and gene mutations. Finally, using geographic information system combining with the results of above detections to locate the distribution characteristic of TB in Yunnan, of which can provide molecular epidemiology reference for the control and prevention of TB.

结核病是以结核分枝杆菌为病原体的重大传染病，耐药结核特别是耐多药结核（MDR-TB）是结核病防治的重点和难点。研究表明，结核分枝杆菌基因型分布存在明显的地域差异。而云南省是一个结核病疫情较严重的多民族边疆省份，具有独特的地理特征和民族分布，完成云南地区结核分枝杆菌基因分型及与耐药相关研究对结核病疫情的控制以及了解多民族地区的结核分枝杆菌基因分布多态性均具有十分重要的意义。因此，本研究拟以云南省32个耐药监测县的涂阳结核病患者作为研究对象。采用多位点数目可变串联重复序列分析(MLVA)和Spoligotyping方法进行基因分型，掌握结核分枝杆菌基因多态性。同时开展药敏试验和耐药基因检测，掌握耐药谱和基因突变情况。进一步探讨基因型与耐药、MDR-TB及耐药基因突变位点的关系。最后，结合患者基本信息、基因型、耐药，利用地理信息系统进行空间定位。为云南省结核病预防、控制提供分子流行病学依据。

结核病是以结核分枝杆菌为病原体的重大传染病，而云南省是一个结核病疫情较严重的多民族边疆省份，具有独特的地理特征。本研究收集了来自云南省32个耐药监测县（市、区）的846例涂阳肺结核病患者，开展了云南省结核分枝杆菌基因多态性及与耐药性的相关性研究。研究结果表明，云南省结核分枝杆菌基因型呈多态性分布特征，结核分枝杆菌北京基因型是云南省的主要流行株，占比达63.71%，但各州（市）间基因性的分布存在显著的差异性。对846株结核杆菌的MLVA研究结果显示云南省结核杆菌成簇率低(25.89%)，从分子水平阐明云南省以散发为主，伴有局部暴发流行的疫情特征。研究还发现，北京基因型菌株成簇率（29.68%）显著高于非北京基因型（19.22%）（P＜0.01），表明北京基因型菌株具有更强的毒力和传播能力。结核分枝杆菌的对异烟肼（INH）、利福平（RFP）的耐药率分别为10.28%和6.38%，耐多药（MDR）率为3.78%（32/846），云南省结核病耐药情况呈下降趋势。验证了利福平耐药相关rpoB基因以531和526位点突变为主，异烟肼耐药相关katG基因以315位点突变为主的分布特征。但不同基因型结核分枝杆菌的主要耐药基因存在差异。北京基因型突变菌株中，rpoB基因最常见的突变发生在531位点（57.58%），其次为526位点；非北京基因型突变最常见的突变发生在526位点，其次是531和其它位点的突变。.本研究首次阐述了云南省结核分枝杆菌的基因型分布特征，研究了结核病的耐药情况和耐药基因特征，并将结核分枝杆菌基因型与耐药紧密结合起来，研究结果对科学制定及评价防治策略具有重大意义。建立了适宜高效的分子鉴定分型策略，对指导全省科学预警和疫情处置具有极高的应用价值。 .