猪15号染色体上显著影响肉pH值的父本印迹基因的精细定位与鉴定

猪肉pH值是衡量肉质优劣的一个非常重要的指标。迄今国际上仅鉴别了两个影响猪肉pH值的主效基因，还有许多显著影响该性状的数量性状位点（QTL）有待深入解析。课题组曾对白色杜洛克×二花脸猪大规模F2家系进行了全基因组扫描，在猪15号染色体上检测到一个同时影响背最长肌和半膜肌pH值的主效QTL，它可解释约8%的表型变异，置信区间约为35cM。该QTL是由某一未知的父本印迹基因所致(Anim Genet.2010)。本项目拟在此基础上，通过增加该QTL区域内标记数量和重组个体数（如F3代个体），采用连锁分析和染色体片段同源一致区（IBD）分析来精细定位此QTL；然后通过分析目的区域内功能基因的印迹遗传模式，确定位置候选基因并搜寻其多态位点，评估变异位点对资源群体和远缘群体的表型影响效应，以鉴定目的基因和关键突变位点。此研究将有助于猪肉品质的遗传改良和中国二花脸猪的优良肉质基因的开发利用

猪肉质性状是重要的经济性状，且属复杂数量性状，受多基因及环境影响。本研究利用两个大规模实验群体，通过全基因组关联分析，高精度地定位了影响肉质性状的多个基因座（QTL）及强关联SNP标记，丰富了人们对肉品质性状形成的分子机制的认识。在此基础上，通过一系列严谨的遗传学分析，成功地鉴定了导致我国养猪生产中瘦肉型商品猪产生劣质酸肉的主效基因及其因果突变位点（PHKG1 g.8283C>A），并建立了相应的分子辅助标记育种技术。研究论文已发表在国际遗传学研究领域的著名期刊《PloS Genetics》(2014, 10: e1004710)上，且相关成果已申请国家发明专利。. 本研究发现的PHKG1基因是迄今国际上家猪遗传研究领域鉴别到的第三个复杂性状主效基因，也是国际上在农业动物中首个采用整合系统生物学方法鉴别到的猪经济性状因果基因。这一成果不仅具有重要的理论意义，而且具有极显著的社会经济效益，对我国养猪生产中的肉质遗传改良具有重大推动作用。