单纯型牙齿发育异常的大样本多基因SNP研究及GlI基因的功能分析

单纯型牙齿先天缺失是口颌面系统最常见的遗传发育性疾病，而其的突变检出率不高，提示单纯性牙齿先天缺失的发生可能为多基因控制的复杂疾病，基因多态性的研究将有助于进一步认识复杂的多基因疾病，是对其病因学研究的一个广阔的领域。本项目拟在以往工作的基础上，从两方面开展研究。第一部分在牙齿发育相关基因中选择多个候选基因的一系列多态性位点，拟用超过1000例的大样本多基因约100个相关位点的平行研究，探索基因单核苷酸多态性与单纯性牙齿先天缺失发病易感性的关系，以及基因型与表现型的关系。第二部分拟对已发现的有多态性变异的GLI基因功能进行研究，用体外实验研究变异对蛋白质功能的影响；用微流控快速高通量Western blot芯片检测方法，探讨位于调控区的变异对相关信号分子及细胞因子的调控作用。利用中国人病源资料丰富的特点，探索牙齿生长发育中的科学问题，为临床常见的牙齿先天缺失疾病提供可能的病因诊断

单纯型牙齿先天缺失是口颌面系统最常见的遗传发育性疾病，而其突变检出率不高，提示单纯型牙齿先天缺失的发生可能为多基因控制的复杂疾病，基因多态性的研究将有助于进一步认识复杂的多基因疾病，是对其病因学研究的一个广阔的领域。. 本研究在362例缺牙患者和200例正常人的DNA样本中，检测了20个牙齿发育常见基因上的50个多态性位点。通过统计分析，发现了四个基因(GLI3, DKK1, EDARADD和DLX1)上的5个SNP位点(rs929387, rs11001553, rs3916983, rs7888172 and rs813720)在正常人群和缺牙人群中的分布存在差异。另外在性别和位置的分型统计中也得到了统计学差异。对于GLI3基因上的rs929387位点进行了功能研究，研究结果证实了该位点多态性可以影响转录因子GLI3的活性，可能对于牙齿发育是一个危险因素。. 本研究是国际上同类研究中样本量最大的，研究基因和位点最多，并且填补了针对中国人群研究的空白。另外，在本研究中我们首次采用了性别分型的研究。. 研究结果发现了多个基因上的多个多态性位点与汉族人群的先天缺牙存在相关性。在国际上首次发现了GLI3基因上面的一个位点rs929387与先天缺牙存在相关性，并进行了功能验证。发现了DKK1基因上面位点rs11001553与先天缺牙存在相关性，并进行了生物信息学分析。发现了先天缺牙人群的基因多态性分布存在性别差异。研究结果目前为止共发表SCI论文3篇。培养博士研究生1名，硕士研究生1名。. 本研究利用中国人病源资料丰富的特点，探索牙齿生长发育中的科学问题，为临床常见的牙齿先天缺失疾病提供可能的病因诊断，为我们深入了解先天缺牙的病因机制提供了研究基础。