用分子动力学方法研究短多肽的积聚

用分子动力学方法（molecular dynamics, MD）研究短多肽的积聚机制，讨论几种序列的短多肽，KLVFFAE(ABeta16-22)，NFGAIL，STVIIE积聚的过程。主要模拟四个和八个多肽的积聚，并通过点突变，讨论疏水相互作用和侧链间的氢键作用对于寡聚体形成的影响。实验表明积聚过程中，多肽从无规卷曲(random coil)积聚成beta片层结构，是一个成核生长的过程，通过比较不同序列的多肽积聚过程的模拟,研究这个实验得出的规律，如何在不同多肽的积聚过程中体现。另外，疏水相互作用和氢键作用都能促进积聚的发生，但前者作用距离比较长而且没有特定位点，而后者刚好相反，对它们进行比较有助于我们进一步了解积聚过程的限制因素。