基因表达谱分析在生物材料生物相容性机理研究中的应用

本课题拟应用基因表达谱分析进行Ni2+的细胞毒性分子机理研究。首先用MTT实验对Ni2+的细胞毒性进行评价, 接着用基因芯片技术进行Ni2+基因表达谱实验。设计分析软件，对基因表达谱实验数据进行分析，找出差异表达基因，研究这些差异表达基因随Ni2+不同作用时间和浓度表达的规律。同时应用数据处理和分析工具等生物信息学方法对基因芯片上基因信息（序列、编码蛋白质和相关文献）进行批量查询，按照所对应的蛋白质功能（如DNA合成和修复、细胞周期蛋白等）进行分类，并构建本地（二级）数据库，把查询和分类结果导入数据库。再根据数据库建立的基因分类信息，对基因表达芯片的实验数据进行进一步关联分析。探讨这些差异表达基因对相关功能蛋白质合成的影响乃至对细胞代谢活动调控的影响，从而揭示Ni2+产生细胞毒性的分子机理，并为应用基因芯片表达谱分析在基因组水平上开展其它生物材料的生物相容性机理研究探索一条高效的路子。