环境压力对人类MDMX基因的进化选择研究

基本信息
批准号:31071101
项目类别:面上项目
资助金额:38.00
负责人:石宏
学科分类:
依托单位:中国科学院昆明动物研究所
批准年份:2010
结题年份:2013
起止时间:2011-01-01 - 2013-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:彭忆,彭应梅,杨召辉,曹向宇,张慧
关键词:
MDMX人类群体遗传环境压力基因进化自然选择
结项摘要

MDMX是人类重要的原癌基因,与多种癌症的发生有很强的相关性。该基因在人类最近的进化过程中受到自然环境压力的选择,最近报道的结果和我们前期的研究结果都证实MDMX基因受到很强的达尔文正选择。外界环境压力通过MDMX基因改变p53的表达实现对下游基因的激活和抑制,调控细胞和组织的相关基因表达调控网络的启动和关闭,实现抑制癌症、诱导细胞调亡和应对外界环境压力等功能。本项目结合群体遗传学和分子生物学手段分析MDMX基因在人群中特异性变异SNP位点的频率变异与环境因素的相关性,在覆盖全东亚的人群中寻找促使该基因变异的环境压力。并针对这些SNP的变异带来的功能后果进行研究,探讨MDMX基因受环境因子选择的机理。这些结果对癌症发生风险评估和相应治疗手段选择、基因治疗靶位点的选择以及相关药物的开发都是十分重要的基础数据。

项目摘要

经过测序分析,我们没有在MDMX基因的编码区和3’UTR区域发现东亚人群中存在多态性位点。通过生物信息学分析,我们从MDMX基因上筛选出5个SNP位点进行人群筛查。已经完成东亚代表性69个人群超过4000多份样本的MDMX基因上5个SNP位点的检测和单倍型分析。发现其中2个Snp位点与环境辐射相关,同时也表现出与经度相关。通过分别合成带生物素标记的包含这写SNP位点的DNA片段(40bp)展开不同SNP单倍型的凝胶迁移实验(EMSA)分析,通过与预测的转录因子的结合抚育,再用电泳分型,抗体结合生物素显影等手段。没有看到这5个SNP位点与预测转录因子结合效率上有显著差别,通过这个实验结果我们可以知道,这几个有功能后果的SNP在转录水平上至少在招募转录因子结合这个环节上没有对表达调控水平表现出差别。.对MDMX基因上Snp与环境因子的作用机制我们正在逐步深入开展研究,将从表达水平上看这个5个SNP相关的单倍型直接是否存在表达水平上的差异,从而分析这5个SNP对调控MDMX的功能在哪个环节上期作用。还会涉及这5个SNP对该基因mRNA的稳定性保持的关系,以及对基因表达水平是否还存在其他方面的调控机制。.基本上完成了项目申请的内容,相关研究论文正在修改和投稿过程中。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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