基于约束独立分量分析的肿瘤DNA微阵列数据分析新算法研究

基本信息
批准号:30700161
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:18.00
负责人:郑春厚
学科分类:
依托单位:中国科学院合肥物质科学研究院
批准年份:2007
结题年份:2010
起止时间:2008-01-01 - 2010-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:王红强,李波,米建勋,夏俊峰,稳国柱,徐欢
关键词:
独立分量分析基因表达数据DNA微阵列聚类分析
结项摘要

本项目研究肿瘤基因表达数据的约束独立分量分析(ICA)建模,在此基础上研究基于约束ICA模型的肿瘤基因表达数据的聚类分析问题。针对基本线性ICA在基因表达数据建模方面存在的诸如分量数目难以确定、算法稳定性有待提高、分量排序困难等缺点,研究利用基因表达数据中蕴含的基因调控等生物信息,构建符合生物意义的DNA微阵列数据约束ICA模型,进而研究ICA模型中特征基因和特征样本的统计规律与生物内涵,提取与肿瘤类型关系密切的关键基因,对肿瘤样本进行分类研究。研究合理的基因聚类数目评价标准,在利用约束ICA对DNA微阵列数据建模的基础上,对基因表达数据进行基因功能和肿瘤样本聚类分析。最终探索出一套基因功能分类和基因肿瘤样本诊断预测的实用方法,从而为促进肿瘤基因组学和药物基因组学的进一步研究打下基础。

项目摘要

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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