Oral Lichen Planus is a common, non-infectious autoimmune disease, which often accompanied by chronic inflammation of the superficial mucosal keratosis. OLP is a chronic disease and which is accepted as a precancerous condition, it has a serious impact on oral health, thus can significantly reduce the quality of life. So far there is no effective methods for prevention or early diagnosis of OLP. Intensive study of the etiology and pathogenesis of OLP is the key to solve the problem. OLP is a complex disease that multiple genetic factors and environmental factors are involved in the pathogenesis of OLP. We have already studied OLP for years and collected a large number of patient samples. In this study, based on the existing foundation, we are going to build a comprehensive management and analysis database for OLP of Chinese population; use high-throughput exome sequencing technology in combination with case-control association analysis to discover new loci/gene associated with OLP; research environmental factors such as alcohol and smoking, study the interaction and joint effect of environmental factors and genetic factors in the pathogenesis of OLP; we will further study the functions of the proteins of related genes to uncover the underlying mechanisms to establish a firm foundation to improve early diagnosis, prevention and treatment of OLP.
口腔扁平苔藓(oral lichen planus, OLP)是一种常见的非感染性,伴有慢性浅表性炎症的黏膜角化异常的自身免疫性疾病。其病程迁延,有癌变风险,是严重影响口腔健康,降低生存质量的主要原因之一。目前为止没有有效的OLP早期诊断和预防手段。对OLP的病因、病理机制的研究是解决OLP问题的关键。OLP是一类由多基因和环境因素交互作用而致病的复杂疾病。我们已经对OLP进行了多年的研究,收集大量的OLP病人样本,本项目拟在现有的研究基础上,建立中国人群OLP的资源管理和综合分析数据库;采用高通量外显子组测序技术,采用病例-对照关联分析(case-control association study),发现新的OLP的相关位点/基因;开展遗传易感因子和环境因素(吸烟、饮酒)的交互作用及其协同致病效应的研究;并研究相应的蛋白质功能,寻找真正的致病机理,为OLP早期诊断,预防和治疗奠定基础。
口腔扁平苔藓(oral lichen planus, OLP)是一种常见的慢性、非感染性自身免疫性疾病。其病程迁延,反复发作,且有癌变风险,严重影响口腔健康,降低患者生存质量。目前认为OLP是一类由遗传因素和环境因素共同作用的复杂疾病。该研究的目的是标准化收集OLP患者队列样本及临床信息资料,通过先进的二代测序技术,获得典型病例的DNA序列信息,并综合利用生物信息学技术对数据进行挖掘,发现高风险位点/基因,并通过实验室手段对发现的位点/基因进行生物学功能研究,同时对影响OLP发生发展的外在因素进行相关性研究。.本研究在收集大量病例样本的基础上,严格纳入排除标准,建立了标化的OLP多中心样本库及信息管理数据库,精选3例典型的OLP病例进行全基因组二代深度测序研究。对获取的序列信息进行严格质控,而后对海量的基因组序列信息进行疾病相关性分析,采取一套多过滤器的模式对序列数据进行疾病风险度评估。而后对每个样本数据中出现高风险度的位点进行比对,最终找到2个3病例共有的高致病性的位点,分别位于STON2和OR1A2基因。并利用以下试验初步研究其生物学功能 1.使用HHpred对这些蛋白进行三维模型构建。对于STON2,发现Ser851位于MHD 结构域的β折叠上。S851A可能会影响STON2和AP2复合体的相互作用,从而可能导致膜运输异常。对于OR1A2,发现Gly256位于穿膜螺旋6胞外区域,对于G蛋白的募集具有重要的作用,G256C可能影响Gpcr的动态,从而影响对激动剂的结合。2.免疫组化试验对STON2和OR1A2在OLP及正常上皮中表达情况进行了研究发现,STON2和OR1A2在OLP上皮均呈现明显的阳性结果,而在正常对照上皮中却鲜有表达。3.运用Q-PCR对OLP组织和正常对照组织中STON2和OR1A2的表达量进行了研究,发现OLP中STON2和OR1A2表达量均大大高于正常黏膜组织。对OLP相关的重要的外部交互因素口腔微生物进行了的研究,建立了中国口腔微生物组数据库。.该研究采用二代测序技术,并使用多数据库对测序数据进行疾病风险预测的方法,发现了2个新的OLP易感基因,并对其进行了初步的功能学研究,为OLP早期诊断,预防和治疗奠定基础。
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数据更新时间:2023-05-31
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