中国汉族人群原发性干燥综合征易感基因GTF2I的分子作用机制的研究

基本信息
批准号:81571594
项目类别:面上项目
资助金额:58.00
负责人:张奉春
学科分类:
依托单位:中国医学科学院北京协和医院
批准年份:2015
结题年份:2019
起止时间:2016-01-01 - 2019-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:彭琳一,姜楠,赵云,张昊泽,连超峰,柯岩,荣溪
关键词:
易感基因分子作用机制原发性干燥综合征GTF2I
结项摘要

Primary Sjogren's syndrome (pSS) is one of the most common autoimmune diseases. Based on our previous genome-wide association studies of pSS, we had found GTF2I which was associated with pSS. The results of fine-mapping shown that rs117026326 which located in the intron of GTF2I and the inter-genetic region between GTF2I and GTF2IRD1 were associated with pSS. However, it still remained unclear that how did GTF2I effect the mechanism of pSS. T Thus, we strive to explore the mechanism of GTF2I in pSS in accordance with the following aspects. Firstly, analyze the association between different allele of rs117026326 and GTF2I transcripts; secondly, figure out the association between Nsv517573 and rs117026326 and GTF2I transcripts; last but the least, inquiry whether there were pSS associated variants located in the transcriptional regulatory elements of inter-genetic region between GTF2I and GTF2IRD1, and analyze the effects of pSS associated variants on transcription factors. What’s more, it may also influence the initiation and induction of pSS. With the implementation of this program, it will do a lot in the comprehensive understanding of the pathogenesis of GTF2I in pSS and promote a lot in the thorough acquaintance for the pathology of pSS.

原发性干燥综合征(pSS)是最常见的系统性自身免疫病之一。本课题组前期对pSS进行了全基因组关联分析,发现了一个中国汉族人群特异的疾病易感基因GTF2I。进一步的Fine-mapping 结果显示GTF2IRD1-GTF2I基因间区及GTF2I(rs117026326)与pSS显著相关。但其在pSS中的分子作用机制尚不清晰。因此,我们拟首先分析rs117026326与GTF2I不同转录本间的关系;其次分析 GTF2I 基因内拷贝数缺失变异Nsv517573与pSS易感性及rs117026326之间的相关性;再对GTF2IRD1-GTF2I中的转录调控元件活性的区域进行Sanger测序,通过体内及体外实验分析并确定转录调控元件中pSS 易感位点所结合的转录因子。本项目的开展可全面的深入了解GTF2I在pSS中分子作用机制,对深入了解pSS的发病机制可起到积极的推动作用。

项目摘要

原发性干燥综合征(primary Sjogren’s syndrome, pSS)是泪腺、唾液腺等外分泌腺受累为主的慢性自身免疫性疾病。目前pSS发病机制仍不清楚,本课题组前期对pSS进行了全基因组关联分析,发现了中国汉族人群特异的疾病易感基因GTF2I。因此本研究目的 是 对 GTF2I(rs117026326) 与 pSS 相关性以及 GTF2I 的结构变异的转录本进行分析,同时在 B 细胞内过表达 GTF2I 来观察其对 B 细胞的增殖以及分泌免疫球蛋白水平的影响。.结果发现,pSS患者风险多态T的基因频率高于HC对照(OR,2.2;95%CI 1.094 ,4.458;P=0.0378)。不同转录本的表达量之间有统计学差异( p<0.0001 ),主要以 GTF2I β 和 GTF2I δ 的表达为主。GTF2I β/Total 比值在基因型 C/T 、T/T 明显低于C/C (P=0.0017, P=0.0044 )。GTF2I-δ/Total在基因型C/T,T/T中明显高于在C/C中,(P=0.00198,P=0.0017)。风险多态T引起GTF2I-δ表达的增加。B细胞分别过表达 β 和 δ 转录本基因后,培养至第 3 天检测 B 细胞凋亡,结果显示 与对照组无明显差异。在 anti IgM+CD40L 检测细胞增殖情况,转染δ excess质粒组增殖细胞数明显高于转染 control 组的增殖细胞数( P=0.0023) ;而转染 β excess 组增殖细胞数与转染 control 质粒组之间无统计学差异。培养至第 6 天 检测 IgG IgA IgM 分泌情况,各组之间均无统计学差异。pSS患者中,IgG升高组Total GTF2I表达量显著高于IgG正常组(P=0.0186)。抗SSA抗体阳性组GTF2I-β/Total显著低于抗体阴性组(P=0.0054)。.意义:我们发现了中国汉族人群原发性干燥综合征的一个特异SNP位点GTF2I(rs117026326)风险T基因型 与 pSS 的发病强相关,并可影响GTF2I不同转录本的表达量 ,其中 C/C 基因型型以 GTF2I β 为主, C/T 和 T/T 型以GTF2I δ 为主 。 GTF2I δ 可以促进BCR 激活的 B 细胞的活化和增殖,提示GTF2I可能参与pSS的发病机制.

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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