亚热带-热带旋唇纲纤毛虫原生动物的DNA库构建及基于多基因分析的系统探讨

旋唇纲纤毛虫是最复杂、类群分化度最高的一类原生动物，在系统演化、基因表达与细胞分化、核-质关系探讨等研究领域均为重要的关注对象，也是近年来纤毛虫学研究的热点之一。当前，国际间围绕该类群探讨的突出问题是：种类鉴别、系统构建等所必须的重要、关键及代表性类群之分子信息普遍缺失或严重不足，此导致了近半数类群的系统定位和亲缘关系梳理无法开展、大量不明类群难以鉴定。广东沿海代表了物种多样性极高的热带-亚热带水体，是旋唇纲纤毛虫的最丰富的栖息地之一。本工作聚焦于此海域，内容和目的包括：分离、鉴定、克隆未知株系；建立重要目标种的DNA库；开展核糖体小亚基基因、微管蛋白基因等标记性基因的测序；为我国亚热带-热带种的鉴定及DNA条形码计划的开展提供重要的DNA素材和分子档案；同时，在多基因分析的基础上，结合形态学、发生学等信息，完成对纲内高度存疑的1-2个目级系统的修订和重构建。

本研究自2011年1月起至2013年12月结束，利用多基因系统树构建、二级结构预测等方法，开展了旋唇纲4个目级阶元的系统关系重新厘定，并对DNA提取、基因标记选择、系统树构建等关键技术/方法进行了深入的研究探讨。主要内容包括：1）完成了共计109物种/种群的DNA提取，以及232条序列的首次测定；2）基于多基因序列信息，并结合形态学与细胞发生学特征对旋唇纲内部系统关系较为混乱的尾柱目、游仆目、盘头目、丁丁虫目的系统关系进行了详细梳理；3）在详实的数据分析的基础上，对纤毛虫分子系统学后续研究在单细胞DNA提取、基因标记选择、数据选择等方面提出了可行性建议；4）采集、鉴定并探讨了6种病原性纤毛虫的系统位置划分；5）建立了1 个新属、5 个新种、1个新组合，并完成了3个已知种的形态学重描述。上述成果累计形成SCI论文10篇、核心期刊文章1篇，为后续纤毛虫分子系统学研究的开展提供了一定的方法参考和大量的数据支持。