脊椎动物信号转导和表达调控相关基因家族的比较进化基因组学分析

我们计划采用一系列生物信息学的方法对脊椎动物信号转导和表达调控系统的复杂性进化进行研究，从而验证该系统相关基因家族与脊椎动物细胞类型数的扩增是否均主要发生于脊椎动物进化的早期。这对阐明导致脊椎动物复杂性的内在机制具有重要意义。通过对该系统中三个重要的超基因家族：蛋白质激酶、转录因子和G蛋白偶联受体，以及脊椎动物miRNA基因进行基因组水平的系统发育分析，检验它们是否均主要产生于脊椎动物发生的早期。我们还将借助标准基因词汇体系(Gene Ontology)分析人和小鼠细胞信号转导和表达调控相关基因家族，研究该类基因发生倍增的年代和其他基因的差异。同时，以G蛋白偶联受体B家族成员功能分化分析为例，我们将构建一套综合多种功能基因组学数据，包括选择性剪切、基因芯片、EST、miRNA靶位点及miRNA表达数据等，对基因家族功能分化进行全面分析的实验流程，为更大规模的基因超家族功能分化分析奠定基础。