新生肽链伴同翻译折叠过程的动态蒙特卡罗模拟研究

作为联系遗传信息与生物功能的桥梁，蛋白质折叠一直是科学界的研究热点和难点之一。与完整多肽链的体外再折叠过程不同，新生肽链很可能在尚未完全合成之前即已开始折叠，是一个边合成、边折叠的伴同翻译折叠过程。目前的实验工作集中于获取核糖体上新生肽链的静态折叠状态或三维结构，尚未涉及伴同翻译折叠过程中链构象的动态调整过程；而已有的模拟工作大多采用高度粗粒化的格子模型，难以形成精细的二级结构，无法对动态过程进行更深入的研究。申请人拟通过构建含有明确二级结构（α-螺旋）和三级结构，且二级结构片断不能稳定独立存在的模型蛋白，借助于中等粗粒化程度的四单元非格子模型以及动态蒙特卡罗模拟方法，模拟新生肽链的伴同翻译折叠过程；并引入分子伴侣，考察其对新生肽链折叠构象的稳定功能，以求在新生肽链伴同翻译折叠的动态调整过程、对分子伴侣的依赖性关系以及与体外再折叠的异同等方面获得初步认识，并为后续实验探索提供参考和指导。