Small self-cleaving ribozymes were discovered more than 30 years ago, each ribozyme family has its distinct structure and unique catalytic center. Three new small self-cleaving ribozymes were identified recently including twister-sister, pistol and hachet. Pistol ribozyme is the smallest one, but is also the only one with pseudoknot scaffold structure. So how does the RNA molecules fold into a stable three-dimension structure? How does the structure catalyze the cleavage reaction? Which nucleotides play the key roles in cleavage reaction? Is there any Mg2+ or small molecule involved in the reaction? And what’s the potential application of the new ribozymes? To answer these questions, we will launch a comprehensive study of the structure and catalytic mechanism of pistol ribozyme using x-ray crystallography method and the related functional study methods.
小的自身剪切类核酶(50到150个碱基)发现于30多年前,已发现的每类核酶都具有不同的结构特征和独特的催化中心。最近报道的三类新型小的自身剪切类核酶twister-sister, pistol和hachet中,Pistol核酶是其中最小,但却唯一带假结结构的核酶。那么它是如何折叠形成稳定的核酶结构?该结构又是如何促进酶切反应的进行?哪些核苷酸起着关键作用?有没有Mg2+或其他小分子化合物参与到反应中以及该核酶又具有哪些应用前景?这些问题都尚未得到解决。在本项目中申请人将通过x-射线晶体学的方法以及相关的功能实验开展对新型核酶pistol的结构与催化机制研究;在此基础上,还将对其生物功能以及潜在的应用前景进行探讨。
小的自身剪切类核酶(50到150个碱基)发现于30多年前,已发现的每类核酶都具有不同的结构特征和独特的催化中心。最近报道的三类新型小的自身剪切类核酶twister-sister, pistol和hachet中,Pistol核酶是其中最小,但却唯一带假结结构的核酶。在本项目中申请人通过x-射线晶体学的方法解析了新型核酶pistol的三维结构,以结构为基础,结合相关的功能实验全面解析了pistol核酶的催化机制。此项工作为研究RNA分子的结构特征与功能关系提供了重要的结构信息; 为开发Pistol核酶在医学、药学等方面的应用提供了一定的理论依据;同时也为“RNA世界起源说”提供了强有力的支持。
{{i.achievement_title}}
数据更新时间:2023-05-31
基于被动变阻尼装置高层结构风振控制效果对比分析
基于改进LinkNet的寒旱区遥感图像河流识别方法
长链基因间非编码RNA 00681竞争性结合miR-16促进黑素瘤细胞侵袭和迁移
RNA-Seq-based transcriptomic analysis of Saccharomyces cerevisiae during solid-state fermentation of crushed sweet sorghum stalks
血管内皮细胞线粒体动力学相关功能与心血管疾病关系的研究进展
I型内含子核酶的折叠、三级结构与剪切功能的研究
小型核酶自切除反应机理和催化活性调控机制的理论研究
基于核酶剪切产物的特异性应用Helicos DRS 测序技术发现新核酶的研究
新型RNA核酶的三维折叠、催化机制研究及其在医药领域中的应用