链霉菌基因组岛的比较组学研究

链霉菌是研究微生物遗传多样性的良好模式材料。对已测序链霉菌的比较分析表明，其染色体不稳定，结构较其他细菌复杂，由较保守的核心区及高度可变的两臂组成；更为重要的是，许多与抗生素合成和致病性等相关的基因簇以基因组岛的形式插入到染色体上。通过水平转移获得的基因组岛有助于维持宿主在特定生态环境中获得优势。本项目拟分析天蓝色链霉菌的重要基因组岛, 包括砷抗性基因组岛及DNA硫修饰依赖型限制系统基因组岛；结合生物信息学和分子实验技术搜索和确定变铅青链霉菌核心区新基因组岛；识别已测序的井冈霉素高产菌吸水链霉菌井冈变种5008的基因组岛。探讨基因组岛对链霉菌基因组稳定性的影响，并为大规模挖掘链霉菌可移动基因组和研究其对遗传多样性和进化的影响提供坚实基础。