黄瓜无侧枝基因的精细定位及候选基因分离

侧枝性状是黄瓜的重要农艺性状之一。我国黄瓜生产中，少侧枝或无侧枝的品种可以提高产量。本项目将利用无侧枝的黄瓜自交系S61开展无侧枝基因（non-lateral-branch, nlb）的研究。通过不同群体的遗传分析，研究不同基因背景对黄瓜无侧枝性状的影响。利用SRAP和SSR等标记技术，筛选出与无侧枝基因紧密连锁的分子标记，并进行精细定位，然后通过黄瓜全基因组序列和BAC文库，图位克隆获得nlb候选基因，并进行功能分析和转化互补验证，探讨其对侧枝形成和生长发育的调控途径。本研究将有助于黄瓜高产品种的选育，促进黄瓜侧枝发育的分子生物学研究。

利用黄瓜基因组测序开发的SSR标记（2010对）加密原有的S94×S06（RIL群体）遗传图谱。新的S94×S06扩充图谱包含610个标记位点（384个SSRs，199个SRAPs，23个SCAR，1个STS和3个形态性状位点），覆盖基因组749.2cM，标记间平均间距1.2cM。对黄瓜的再生体系和转化体系进行了优化。MS+ 6-BA1.0mg/L+ABA1.5mg/L+AgNO32.0mg/L培养基可直接诱导子叶节产生丛生芽，最短45d可获得完整植株。转化体系部分，最佳的预培养时间1-2d，侵染时间20-30min，共培养3d，选择培养阶段kan50mg/L，抗氧化剂的加入可显著提高转化效率。以黄瓜无侧枝品系S61和419，有侧枝品系S06和SB-2为材料，遗传分析表明，侧枝表型（有侧枝:无侧枝）的分离情况符合由一对显/隐性基因控制的分离比率。将此基因命名为nlb（non-lateral-branch），并利用分离群体分组混合分析法（BSA）对该基因进行基因定位。筛选得到nlb 基因连锁标记9 个，通过F2 群体验证和MAPMAKER3.0 软件分析，nlb 基因定位于黄瓜1号染色体，其两侧最近的标记是SSR12258和SSR14596，图距分别为5.3cM和4.1cM。