HBV准种基线预测抗病毒药物反应性和耐药性研究

基本信息
批准号:81101297
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:14.00
负责人:王瑜伟
学科分类:
依托单位:重庆医科大学
批准年份:2011
结题年份:2012
起止时间:2012-01-01 - 2012-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:许舸,张文露,胡源,胡接力,张秀瑜,邓蕙
关键词:
HBV准种耐药预测核苷类似物
结项摘要

慢性乙型肝炎(CHB)是一种难治性疾病, α干扰素和核苷类似物(NAs)抗病毒治疗是目前国际上公认的少数有效的治疗方法。NAs治疗有效、易行、安全,已成为抗病毒治疗的主流方法,但长期使用会产生耐药。目前CHB患者抗病毒治疗的NAs选择没有统一的标准,缺乏像指导临床抗生素应用的体外药敏实验系统。抗病毒药物的选择存在很大的盲目性,正是这种盲目性令NAs抗病毒耐药的管理非常困难。大量的临床结果显示,不同的病人对同一NAs的反应性不一样,同一病人对不同NAs反应也不同。越来越多的研究表明,NAs的不同反应性与HBV存在的准种现象有密切关系。因此,全面研究准种的特点具有非常重要的意义。本课题拟采用高通量的测序技术对准种进行大样本的检测,分析准种在不同NAs作用下的动力学变化,准种的模式组成、比例分布、进化规律等。从而找出具有预测价值的准种特征,建立基线预测的数学模型,更好的指导临床合理用药。

项目摘要

慢性乙型肝炎(CHB)是一种难治性疾病,核苷类似物(NAs)治疗有效、安全,已成为抗病毒治疗的主流方法,但长期使用会产生耐药。研究表明,NAs的不同反应性与HBV存在的准种现象有密切关系。本课题采用高通量的测序技术对准种进行大样本的检测,分析准种在NAs作用下的动力学变化,准种的模式组成、比例分布、进化规律等。从而找出具有预测价值的准种特征,建立基线预测的数学模型,更好的指导临床合理用药。. 首先,我们选择40例ADV治疗一年的CHB患者不同时间点DNA标本。PCR产物混匀进行454深度测序。然后,我们对原始序列进行处理,修正测序的错误。统计各个位点的碱基情况,计算香农熵,统计各个准种的情况,计算每个标本基因型的情况。统计并查看位点主要碱基的含量,找到了具有预测价值的11个位点,其预测准确率80%以上。. 另外,我们对基因型转换问题进行了研究,选择38例ADV治疗一年的病例,用HBV短序列窗口分型方法对所测序列进行基因分型。Sanger测序结果显示,38例病人中有13例发生基因型转换,且主要是C型到B型的转换。而深度测序结果显示,所有发生基因型转换的标本在ADV治疗前已经是B和C型混合感染。进一步用Solexa深度测序对165例临床标本检测其混合感染的情况,结果混合感染比例也很高。进一步分析表明混合感染是基因型转换的基础,选择压力是基因型转换的条件,而不同基因型对药物反应性的差异是基因型转换的关键。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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