T细胞活化过程中cd28/ctla4/icos基因簇附近活性调控元件的鉴定

鉴定活性调控元件(active regulatory elements)是全面了解表达调控网络的关键步骤，也是功能基因组学的重要研究内容。CD28家族的CD28、CTLA4、ICOS是免疫应答启动和效应中的最重要共刺激分子。位于同一"基因荒漠"内的这三个相邻基因受到精细调控，有着各自的表达特点，其在T细胞活化过程中的有序表达对免疫功能的发挥至关重要。但该区域的调控元件未曾得到系统的研究。调控元件在发挥功能时所处的染色质区域变得松散可及，形成DNA酶超敏感位点（DH位点）。后者对应于染色质上的开放结构，是活性调控元件的重要标志。本研究通过分析T细胞活化前后cd28基因簇附近的DH位点来寻找活化前后的活性调控元件，然后结合报告基因、EMSA以及染色体免疫共沉淀等技术来研究这些调控元件的功能。结果将有助于深入了解这三个基因的转录调控机制，也是对这一重要免疫相关区域较全面的基因组注释。

鉴定基因组中存在的调控元件是全面了解表达调控网络的关键步骤，也是功能基因组学的重要研究内容。目前仍有大量功能基因附近的调控元件未能得到系统完整的鉴定分析。CD28基因家族的CD28，CTLA4，ICOS是免疫应答启动和效应中的最重要共刺激分子。位于染色体同一“基因荒漠”内的这三个相邻基因受到精细调控，有着各自的表达模式特点，其在T细胞活化过程中的正确有序表达对正常免疫功能的发挥至关重要。但该区域中存在的调控元件未曾得到系统全面的研究。在本研究中，我们以cd4+T细胞为研究对象，通过分析T细胞活化前后cd28基因簇区域存在的DH位点来寻找活化前后不同的活性转录调控元件。结果发现CD4+ T 细胞活化前后 cd28/ctla4/icos 基因簇区域所处 1M 基因荒漠内存在的 DH 位点13个，利用报告基因实验发现其中影响基因表达的位点5个位点。其中4个能促进基因表达，1个能抑制基因表达。进一步发现与T细胞活化前后相关的位点2个。我们的研究是对 cd28/ctla4/icos 基因簇区域非编码区域功能元件的较全面注释，这些DNA功能元件的鉴定有望为深入研究疾病环境下cd28/ctla4/icos异常活化表达机制提供线索。