中国五个矮马品种的遗传多样性与分子系统学研究

中国矮马以短小精悍、体质结实、温顺和具有广泛适应性而著称于世，与英国设特兰矮马(Shetland)并行共同成为世界的两大原始矮马资源库。历史上由于多种原因使得矮马这一珍稀品种的发展经历了一波三折。关于中国矮马的起源还存在两种学说:即独立起源说和与西南马共源说。目前，关于矮马的来源、影响及系统地位的研究方面还仅限于考古学或史学、染色体比较、生理生化指标和血液蛋白多型分析等方面,以mtDNA为标记的研究还仅限于酶切分析,这些研究结果对矮马的系统学分类也尚无定论。至今为止,基于mtDNA和SSR标记的遗传多样性与分子系统学研究未见报道。鉴于此，本研究将以五个中国矮马品种为研究对象，通过线粒体DNA(D-Loop和Cytb)和微卫星标记两种途径,利用分子生物学研究手段，开展中国矮马的遗传多样性分析和分子系统学研究。为确立中国矮马这一珍稀资源的系统学地位,制定保护和利用计划提供科学依据。

应用13对微卫星引物和mtDNA 双重途径对136匹中国五个矮马品种的遗传多样性进行了分析，获得了有效等位基因数、基因丰富度、杂合度、遗传分化系统、核苷酸多态度、单倍型多态度等遗传参数，分析结果表明，中国矮马具有较为丰富的遗传多样性；应用STRUCTURE软件进行了遗传结构分析，找出了中国矮马与国外矮马品种之间的亲缘关系；从GenBank上下载了Shetland, Zhejiu等国外小型马品种的D-loop序列并进行了聚类分析，并使用Network软件对中国矮马进行了系统学分析，结果显示中国矮马可能具有多重母系起源。