糖蛋白及其天线结构的生物质谱分析

基本信息
批准号:20975024
项目类别:面上项目
资助金额:34.00
负责人:杨芃原
学科分类:
依托单位:复旦大学
批准年份:2009
结题年份:2012
起止时间:2010-01-01 - 2012-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:张扬,周新文,刘晓慧,曹晶,姚鋆,陈瑶函,沈诚频,刘泽
关键词:
糖蛋白糖链结构糖基化位点半自动解析质谱
结项摘要

作为一种普遍存在的翻译后修饰,糖基化对蛋白质的结构和功能有着重要影响。蛋白质糖基化的复杂性决定了糖基化相关分析是对分析技术的一大挑战。尤其是对糖链结构的分析尚缺乏有效的分析工具。本课题试图建立研究蛋白质糖基化修饰谱的共性质谱分析技术:发展凝集素亲和色谱/肼化学法等富集糖肽的技术和外切糖苷酶分离糖链的技术,结合使用高精度的Orbitrap和FTICR质谱仪以解决糖蛋白的糖基化位点分析问题;发展Nano-ESI/MALDI为离子源的多级串级质谱分析技术,以解决糖链分支结构的分析问题;发展ETD和CID结合的高分辨率、高灵敏的质谱技术,以解决支链的糖基序列分析问题;发展基于专家知识的糖蛋白子库产生/搜索和质谱仪器参数的反馈控制,以解决糖蛋白鉴定的结构半自动分析问题。本课题还将利用建立的质谱分析技术,对前期研究发现的肝癌相关的糖蛋白进行糖链分析。

项目摘要

发展了凝集素亲和色谱/肼化学法等富集糖肽的技术和外切糖苷酶分离糖链的技术,结合使用高精度的Orbitrap质谱仪解决了糖蛋白的糖基化位点分析问题;发展Nano-ESI/MALDI为离子源的多级串级质谱分析技术,部分解决了糖链分支结构的分析问题;发展了基于专家知识的糖蛋白子库产生/搜索和质谱仪器参数的反馈控制,编写了GRIP糖蛋白之结构解析软件,部分解决了糖蛋白鉴定的结构半自动分析问题。对前期研究发现的肝癌相关的糖蛋白进行了糖链鉴定。..在课题执行期间,项目主要参加者,博士生陈瑶函、汪弘、张伟毕业并获得博士学位。和本课题有关的研究内容,分别在以下会议上报告和墙报:日内瓦国际蛋白质组组织年度大会,韩国亚洲糖生物学和化学数据库研讨会,长春糖生物学会议,长春质谱学会年会,北京BECIA会议,杭州中国蛋白质组组织大会、亚澳蛋白质组组织大会等。..共发表SCI论文 11篇。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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