高效算法与计算机体系结构融合

本课题通过各类需求共性问题高效优化算法的研究、面向算法的高性能计算机系统结构的研究、算法与高效能计算机相融合的研究，探索如何解决既满足需要造价数亿、甚至数十亿元的昂贵高性能计算机的信息安全、信息加密破密和生物信息处理等重大项目的需求，又能大幅度降低算法与计算机系统的成本的相互融合的新算法和新高性能计算机体系结构。课题主要研究内容有：（1）各种不同需求和各种不同结构的他匹配算法；（2）各种不同需求的自匹配算法；（3）算法优化；（4）面向串匹配算法的计算机系统或者专用部件系统结构；（5）算法与系统结构融合的优化算法和对应的新系统结构。