广西眼镜王蛇毒液捉取物CM-11。为含五对双硫键,由72个残基组成的长链神经毒素。对其水溶液(PH=3.5,T=297K),进行了DQFCOSY、TOCSY、NOESY等一系列二维NMR研究。在完成其氢谱谱线完全归属的基础上,用主链引导法等方法,确定了其二级结构:含三段反平B折叠服(I20-W26、R37-A43和V53-S59),一段又螺旋构象(W30-G35)和四个可能的转角(P7-K10、C14-G17、K50-V53、D61-N64);由NOESY和DQFCOSY谱获取距离和二面角约束条件,利用度量距离几何计算了初始结构。再用模拟退火法和分子动力学方法进行优化。确定了CM-11的溶液空间结构。12个但能分子的骨架和所有重原子的RMSD分别为0.14nm和0.20nm。距离约束偏差不超过0.05nm,二面角偏差≤3(0)。
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数据更新时间:2023-05-31
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