蛋白质专一性极化力场在蛋白质药物相互作用研究中的应用

蛋白质与药物的相互作用计算是合理化药物设计的基础。然而目前由于受到分子力场参数精度的限制，相互作用能的预测精度有待提高。张增辉教授课题组新近发展的蛋白质专一性力场方法（PPFF）将环境的极化效应引入固定点电荷力场参数，为每一种蛋白质提供处于天然构象时的原子电荷参数。该方法克服了目前广泛使用的分子力场方法的不足，从而提高了蛋白质等生物大分子体系理论计算的精度和效率。对部分蛋白质结构和性质的研究表明该力场方案优于传统的力场方法。本研究计划旨在将此蛋白质专一性力场方法推广到蛋白质与药物相互作用能的预测中。通过对具体体系的研究，验证该理论方法对蛋白质与药物结合研究的有效性，进一步发展此力场方法，并且为合理化药物设计提供新的依据。