HIV/AIDS湿热内蕴证免疫相关基因及MicroRNA分子网络构建

AIDS is a major global public health and social problem . Chinese medicine against AIDS have a certain effect . Syndrome as the core of the theory of syndrome differentiation and treatment in traditional Chinese medicine is the most basic and important part of Traditional Chinese Medicine in researches on prevention and treatment of AIDS.Transcriptome studies gene transcription in cells and the law of transcriptional regulation on the overall level.It can interpret syndrome of traditional Chinese medicine from a multi-angle and multi-link point of view . . This project through group found during the Eleventh Five-Year HIV/AIDS in damp permit Gene and MicroRNA research data mining, screening of HIV/AIDS damp Certificate immune-related genes and MicroRNA, using of the immune gene chips on the three sets of objects of the hot and humid intrinsic syndrome of HIV/AIDS, no obvious syndrome of HIV/AIDS and healthy person to validate the immune-related genes and MicroRNA, Using quantitative PCR to confirm the specific immune-related genes and MicroRNA, researching of HIV/AIDS immune molecules of the damp card mechanism to build the syndromes of immune molecules network model, and provide the experimental basis and reference for the establishment of Chinese medicine treatment of AIDS research platform to provide technical support for AIDS TCM treatment objective and standardized..

艾滋病为全球重大公共卫生问题和社会问题，中医药防治艾滋病有一定的疗效。证候是中医药防治艾滋病研究最具基础和重要部分，转录组学从整体水平上研究细胞中基因转录情况及转录调控规律，能够从多角度、多环节的阐释中医证候实质。. 本项目通过对课题组在十一五期间发现了HIV/AIDS湿热内蕴证相关基因及MicroRNA研究数据进行分析，筛选免疫相关基因及MicroRNA，通过制作芯片进行验证并确定特异性基因及MicroRNA，分析特异性基因的功能及相互关系，探索HIV/AIDS湿热内蕴证的免疫分子机制，并对其T淋巴细胞亚群进行检测，分别从细胞、分子层面研究艾滋病的损伤人体的免疫作用机制，运用数据挖掘的方法构建HIV/AIDS湿热内蕴证免疫相关数学模型和分子网络模型，为艾滋病中医辨证治疗客观化和标准化提供实验依据和参考，为建立治疗艾滋病中医药研究平台提供技术支撑。

辨证论治是中医特色之一，中医证侯生物学基础研究是中医药现代化的重要组成部分，课题组在国家“十一五”科技重大专项艾滋病中医基本证候系统生物学研究中发现HIV/AIDS湿热内蕴证相关差异基因及MicroRNA。本项目基于艾滋病主要侵犯机体免疫功能这一病理特点，在前期研究的基础上，针对HIV/AIDS湿热内蕴证差异mRNA及MicroRNA的对应关系进行了进一步分析，筛选出待检测21个免疫相关基因，同时查阅艾滋病相关文献，参考Innate ＆ Adaptive Immune Response PCR Array共确定41个免疫相关基因为检测基因；以筛选免疫相关基因为依据，确定了7个MicroRNA，并以此为模板分别制作RT2 Profiler PCR Array mRNA、microRNA芯片进行检测，探索HIV/AIDS湿热内蕴证的免疫分子机制。采用流式细胞仪进行T淋巴细胞亚群检测，运用多元线回归分析、关联规则等数据挖掘方法，分析HIV/AIDS T淋巴细胞亚群与免疫相关基因表达及MicroRNA的相关性。研究结果显示：HIV/AIDS湿热内蕴证与健康对照组免疫相关基因统计结果显示有统计学意义免疫相关基因19个，其中基因表达量升高的有6个；表达量降低基因有13个。有统计学意义免疫相关MicroRNA 2个，分别为hsa-miR-25-5p、hsa-miR-182-3p，两者表达量均增高。差异免疫相关基因本体功能主要涉及有炎症应答、免疫应答、趋化等；主要涉及信号通路Cytokine-cytokine receptor interaction、Chemokine signaling pathway、Toll-like receptor signaling pathway、TNF signaling pathway等。HIV/AIDS湿热内蕴证CD分子与免疫相关基因相关性分析结果显示CD28+/CD4+免疫相关基因最多，有13个免疫相关基因；免疫相关基因与CD分子相关性最多的为EGR1，有4个CD分子。通过对HIV/AIDS湿热内蕴证免疫相关MicroRNA靶基因与差异免疫相关基因关联分析，建立了HIV/AIDS湿热内蕴证差异免疫相关基因及MicroRNA分子网络模型。