植物基因组中渗透胁迫应答基因的挖掘

本研究利用已有的生物信息资源，从TRANSFAC、TRRD等数据库中搜集渗透胁迫应答顺式作用元件，并按其在渗透胁迫信号转导中的位置进行整理、归类，按照随机序列模型开发设计出一套通过分析启动子区域推断其下游基因功能的算法及软件；同时从NCBI核酸数据库中搜集已知的渗透胁迫应答基因的启动子，同样进行归类，用启动子训练人工神经网络，形成渗透胁迫诱导启动子识别程序，并对其进行评测。用以上软件从拟南芥和水稻基因组序列中挖掘受渗透胁迫反应诱导的基因，采用RT-PCR等方法克隆该基因，对获得的基因进行序列分析和Northern分析，确定其与渗透胁迫的相关性，并为渗透胁迫反应机理的研究提供新的信息。本研究对基因组资源的发掘和功能基因组、生物信息学算法与应用、植物抗渗透胁迫机理等领域的研究都具有重要的科学意义和应用价值。