长江口湿地的纤毛虫原生动物：生物多样性与资源档案的建立

Ciliated protozoans are one of the main components of the microbial community and play an important role in the functioning of microbial food webs in the soil and aquatic ecosystem. Compared to the coastal wetlands of Bohai, Yellow Seas and the south mangroves, habitats around the Yangtze River estuary are very much poorly known in terms of ciliates biodiversity. The present project will carry out studies on the diversity and ecological distribution of ciliates in this area using traditional microscope observations, cytological staining methods and marker genes sequencing technologies. The main content includes species characterization and identification based on taxonomic and molecular data, confusions or errors clarification, DNA collection, spatial and temporal distributions analysis. The research will reveal novel information on the ciliates diversity in the wetlands of the Yangtze River estuary. Furthermore, it will also offer a reference for local environmental monitoring, resources investigation and ecological restoration, and thus benefit the management strategy formulation of the wetlands.

纤毛虫原生动物作为微型生物群落中的核心组成在土壤及水生态系统中具有重要的地位和功能。国内现代意义上的滨海湿地纤毛虫多样性研究主要集中在黄渤海近岸和南方红树林，长江口湿地相关研究几近空白。本项目拟采用传统的显微观察和现代细胞染色、结合标记基因测序等技术，开展长江口湿地纤毛虫的多样性及生态分布研究。具体内容包括：形态特征辅以分子序列进行物种刻画与鉴定、历史分类学资料混乱与错误清理、DNA库构建、典型湿地生境纤毛虫群落结构及时空分布规律探讨等。研究旨在获得长江口湿地纤毛虫多样性的第一手数据,从而为相关环境监测、资源调查、生态修复等工作提供重要参考，也为湿地环境的保护和变迁建立“历史性”档案资料。

纤毛虫原生动物作为微型生物群落中的核心组成在土壤及水生态系统中具有重要的地位和功能。国内现代意义上的滨海湿地纤毛虫多样性研究主要集中在黄渤海近岸和南方红树林，长江口湿地相关研究几近空白。本项目在4年的时间内采用传统的显微观察和现代细胞染色、结合标记基因测序等技术，开展长江口湿地纤毛虫的物种刻画与鉴定、DNA库构建、生态分布规律等研究，取得的项目成果为相关环境监测、资源调查、生态修复等工作提供重要的基础资料。多样性工作完成了32属75种纤毛虫的形态描述与形态鉴定，其中包括1个新属、12个新种和10个中国新记录种，首次揭示了1个属和13个种的纤毛图式信息；构建了长江口地区72个种/种群的DNA库，完成了84条18s、28s和5.8s等标记基因序列测序，同时开展了涉及类群的分子系统关系探讨。生态学方面，在长江口南岸、北岸、中部均设位点进行月度生态采样。eDNA 分析显示纤毛虫在长江口具有丰富的物种资源（2974个ASV），但长江口南岸、北岸以及中部区域共有物种较少（4.9%），南北岸α多样性差异显著，而β多样性则是中部区域显著区别于南北岸。底质类型（沉积物粒径大小）、温度、含水率等物理因素以及盐度、溶解氧、硅酸盐、磷酸盐、氨氮、总氮、硝态氮等化学因素是塑造长江口潮滩纤毛虫群落结构周年变化的主要因子。相关成果发表学术论文11篇，其中包含本领域国际主流刊物10篇。