共感染/超感染在中缅边境注射吸毒人群HIV-1高度重组中的作用和机制研究

In the past ten years, HIV-1 B' and C subtypes were transmitting into Yunnan province from injecting drug users (IDUs) of the China-Myanmar border area, further prevalence and recombination of these two subtypes in Yunnan province led to two new circulating recombinant forms (CRF), CRF07_BC and CRF 08_BC emerge, then radiate and cause a disaster of pandemic in china. In our recent study, It strongly suggests that China-Myanmar border area is a big forge for HIV-1 recombination in the HIV-infected IDUs cohort now. Understanding the mechanism of extremely high frequent intersubtype recombinants in this area will contribute to control HIV/AIDS pandemic of these highly diverse recombinants in China. .Only after different HIV-1 particles co-infected or super-infected a cell, HIV-1 recombination could happen in vivo. So studying the role of co-infections or super-infection will be helpful to reveal the mechanism of HIV-1 recombiantion. In the present study, the blood samples from HIV-infected IDUs in China-Myanmar border area will be collected and approximate 200 HIV-1 positive specimens will be identified. Firstly, by PCR amplification and sequencing of a single gene fragment of HIV-1, the merged bases of the PCR amplificants will be analyzed. Secondly, through inserting the amplificants into T-vector and sequences blast, 8-10 HIV-1 positive specimens of co-infections or super-infections will be identified. Thirdly, by virus metagenomic analysis, the whole genomes of HIV-1 in these patients will be sequenced at different time points. Lastly, by analysis the relationship between co-infections or super-infections and HIV-1 recombination hotspots, the role of co-infection or super-infection in HIV-1 recombination will be partly understood. This study will contritube to understand mechanism of HIV-1 recombination and provide some advices to guard against new HIV-1 recombinant viruses spreading in this area and China.

从中缅边境注射吸毒者(IDUs)传入云南省的HIV-1 B'和C亚型的重组，造成新重组型CRF07_BC 和CRF08_BC在中国的大流行。申请人前期研究表明目前该地区IDUs人群HIV-1感染者是HIV-1重组的"大熔炉"。研究该人群中HIV-1重组及其机制，有助于我国制定HIV-1跨境传播防控策略和预测HIV-1流行趋势。共感染或超感染是HIV-1重组的先决条件。本申请在前期研究基础上，拟从中缅边境IDUs血样中筛选出200份左右HIV-1感染者；然后通过PCR扩增单基因片段测序分析兼并碱基和T克隆测序；鉴定出8-10份共感染或超感染者；最后用病毒宏基因组学方法，对不同时间点内这些病人体内的HIV-1进行全基因组测序；分析共感染或超感染与HIV-1重组热点、重组型别之间的关系。本研究将为研究HIV-1的重组机制和预警该地区HIV-1新型重组病毒的出现和流行提供科学依据和理论指导。

过去10余年间从中缅边境注射吸毒者(IDUs)传入云南省的HIV-1 B’和C 亚型的重组，造成新重组型CRF07_BC 和CRF08_BC 在中国的大流行。为研究该人群中HIV-1 重组特征及其机制，预测HIV-1 在该地区的流行趋势，首先，我们在云南省德宏傣族景颇族自治州瑞丽市的陇川社区收集到IDUs样本202份,发现HIV-1感染率为16.4%。在IDUs的血浆样本中扩增了HIV-1的p17、pol、vif-vpr、vpr-env和C2V3基因片段，进行系统进化分析。发现：BC重组型的比例最高（34.1%），其次为01BC重组型（27.3%），C（14.8%）、01C（10.2%）、CRF01_AE（9.1%）、B（3.4%）和01B（1.1%）。另外，我们收集到缅甸掸邦和克钦邦的戒毒所的吸毒人员样本352份，发现该地区吸毒人员的HIV-1感染率分别为12.3%（31/252）和15.0%（15/100）。对筛选出的46分HIV-1阳性样本进行了近乎全长基因组的扩增。测序成功的样本共有31份，HIV-1重组毒株的流行比例高达96.8%。.这些HIV-1重组毒株来源于病毒的双感染或超感染。接着，我们对这些序列进行重组机制研究。主要结果为：(1)首次在中国以外的区域鉴定CRF07_BC和CRF08_BC近乎全长基因序列；（2）首次在缅甸鉴定新的HIV-1流行重组型：CRF82_cpx和CRF83_cpx；（3）新鉴定的HIV-1流行重组型起源于缅甸；（4）新鉴定的流行重组型已经成为缅甸北部主要的HIV-1流行株；（5）缅甸北部HIV-1二代重组仍在进行；（5）从已发表的独特重组型中鉴定新的HIV-1流行重组型：CRF87_cpx和CRF88_BC；（6）在缅甸北部的长途卡车司机中发现东南亚重组结构最为复杂的HIV-1毒株。 . 因此，本研究揭示：中缅边境地区还在发生着HIV-1的重组，甚至二代、多代重组，更复杂的HIV-1重组毒株可能在不久的将来就会被发现，加强该地区HIV-1流行趋势的监控迫在眉睫。