基于经典脱氧核酶基序搜索“天然”脱氧核酶的研究

基本信息
批准号:31100573
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:25.00
负责人:盛永杰
学科分类:
依托单位:吉林大学
批准年份:2011
结题年份:2014
起止时间:2012-01-01 - 2014-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:孙妍红,李爽,陈非,张代辉,单凝,房克难
关键词:
"天然"脱氧核酶基序BANKGENE
结项摘要

脱氧核酶是一类具有催化功能的DNA分子,自1994年首次获得脱氧核酶以来,已获得多种具有不同催化类型脱氧核酶。然而,目前所有脱氧核酶都是体外进化获得的,即非天然的。许多科学家正在积极努力地探索天然脱氧核酶,但至今未见报道,因此搜索天然脱氧核酶是一个富有挑战性的课题。我们采用NCBI BLAST多重序列比对的方法,以经典脱氧核酶8-17、10-23脱氧核酶的催化结构域基因序列搜索GENE BANK数据库,发现脱氧核酶基因序列在自然界广泛存在。经过活性检测,实验结果表明部分"天然"脱氧核酶序列在体外明显具有切割单链RNA的活性,且切割效率较高、专一性较强,相关的酶学性质、体内活性及生物学作用正在表征之中。"天然"脱氧核酶的发现开辟了脱氧核酶新的酶源,为进一步研究天然脱氧核酶的生物学作用和进化意义奠定了基础。

项目摘要

脱氧核酶是一类具有催化功能的DNA分子,自1994年首次获得脱氧核酶以来,已获得多种具有不同催化类型脱氧核酶。然而,目前所有脱氧核酶都是体外进化获得的,即非天然的。许多科学家正在积极努力地探索天然脱氧核酶,但至今未见报道,因此搜索天然脱氧核酶是一个富有挑战性的课题。我们采用NCBI BLAST多重序列比对的方法,以经典脱氧核酶8-17、10-23、I、II类等多种脱氧核酶的催化结构域基因序列搜索GENE BANK数据库并对搜索到的序列进行活性鉴定及酶学性质表征。研究结论如下:1 与经典脱氧核酶序列相同或相似(突变型)的反式与顺式单链“天然”脱氧核酶序列广泛存在,其中,反式单链脱氧核酶种属分布更为广泛,从低等的原核生物到高等的植物、动物甚至人类。2 “天然”单链脱氧核酶与经典脱氧核酶的催化活性相当,酶学性质具有一定的相似性。3 未发现双链天然脱氧核酶。 “天然”脱氧核酶的发现开辟了脱氧核酶新的酶源,为进一步研究天然脱氧核酶的生物学作用和进化意义奠定了基础。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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