以基因组微阵列选择技术鉴别广西壮族先天性心脏病疾病相关基因

收集广西壮族先天性心脏病（CHD）50个以上家系作为研究对象，将超过600个已知与心脏发生发育相关的基因、已知的人类CHD相关基因以及前期工作研究的感兴趣的基因的探针定制到基因芯片上，利用基因组微阵列选择技术（MGS）,从CHD患者的DNA中筛选出相应的基因，筛选片段经扩增富集后进行Solexa测序，分析壮族CHD患者的DNA序列变化情况，找出突变或特殊的多态性位点，鉴别壮族CHD疾病相关基因；并利用胚胎癌细胞P19CL6在DMSO诱导下分化为心肌细胞的模型，以RNA干扰技术敲除候选基因，根据候选基因各自的特性，研究基因功能，探讨其致病机制。本研究为CHD分子机制的阐明、CHD的产前诊断和早期诊断、遗传咨询以及将来的基因治疗和药物开发提供理论依据。本项目拟与丹麦哥本哈根大学Wilhelm Johannsen Centre for Functional Genome Research合作。

先天性心脏病（CHD）的病因目前认为主要是环境因素与遗传因素共同作用，而遗传因素发挥着极为重要的作用，但到目前为止所鉴别到的CHD 相关基因还很少，CHD的遗传分子机制远未研究清楚。本项目研究的目的在于探讨广西壮族CHD的发病因素，在广西壮族CHD家系中鉴别疾病相关基因。项目收集了520例广西地区CHD的标本，其中包含50个广西本地壮族CHD高发家系的标本，利用基因组微阵列选择技术，以全基因组外显子芯片进行测序捕捉,然后测序及生物信息学方法分析，分析壮族家系CHD的DNA序列变化情况。研究结果发现:广西壮族CHD人群有家族聚集的现象,在50例壮族CHD家系中发现一例GATA4的未报道突变，未发现NKX2.5的突变，提示在该地区壮族CHD家系中GATA4和NKX2.5的突变较为罕见。分析得到的候选基因SP1利用P19C16诱导分化心肌细胞模型进行了RNA干扰研究，但未有证据证明SP1与CHD相关。研究中首次建立了广西壮族CHD人群的标本库，生物信息学分析经验也为CHD基因诊断芯片的研制提供依据。