病原细菌转录因子生物信息学预测与整合分析平台的搭建

基本信息
批准号:30800643
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:18.00
负责人:吴金雨
学科分类:
依托单位:温州医科大学
批准年份:2008
结题年份:2011
起止时间:2009-01-01 - 2011-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:赵方庆,李蔚,白洁,王圣钦,俞通海
关键词:
数据库生物信息转录因子病原细菌支持向量机
结项摘要

转录调控网络的研究对于深入理解病原细菌基本的细胞过程,比如细胞分化,生长控制、随外界环境调控的表达情况以及致病机制具有重要的意义。转录因子通过和转录因子结合位点结合来增强或抑制基因表达,是重建转录调控网络的第一步。因此,迫切需要发展相关算法准确地对转录因子进行预测,并揭示病原细菌转录调控因子其与生理特征、耐药机制之间的关系。.本课题将开发一个基于统计学习理论的支持向量机算法,实现对病原细菌转录因子自动化高准确度高灵敏度地预测,并挖掘一些潜在的未知转录因子,特别是未经发现的病原细菌转录因子基因家族,供进一步基因功能研究。然后搭建病原细菌转录因子在线数据分析平台,为从事病原细菌转录因子相关研究的科学家提供有关转录调控因子的各种重要信息和功能分析工具。最后利用比较基因组学和分子进化手段,研究不同病原细菌转录因子及其相关家族的分子进化机制,揭示其与生理特征、耐药之间的关系。

项目摘要

项目成果
{{index+1}}

{{i.achievement_title}}

{{i.achievement_title}}

DOI:{{i.doi}}
发表时间:{{i.publish_year}}

暂无此项成果

数据更新时间:2023-05-31

其他相关文献

1

DeoR家族转录因子PsrB调控黏质沙雷氏菌合成灵菌红素

DeoR家族转录因子PsrB调控黏质沙雷氏菌合成灵菌红素

DOI:10.3969/j.issn.1673-1689.2021.10.004
发表时间:2021
2

一种光、电驱动的生物炭/硬脂酸复合相变材料的制备及其性能

一种光、电驱动的生物炭/硬脂酸复合相变材料的制备及其性能

DOI:10.16085/j.issn.1000-6613.2022-0221
发表时间:2022
3

基于LASSO-SVMR模型城市生活需水量的预测

基于LASSO-SVMR模型城市生活需水量的预测

DOI:10.19679/j.cnki.cjjsjj.2019.0538
发表时间:2019
4

基于SSVEP 直接脑控机器人方向和速度研究

基于SSVEP 直接脑控机器人方向和速度研究

DOI:10.16383/j.aas.2016.c150880
发表时间:2016
5

自然灾难地居民风险知觉与旅游支持度的关系研究——以汶川大地震重灾区北川和都江堰为例

自然灾难地居民风险知觉与旅游支持度的关系研究——以汶川大地震重灾区北川和都江堰为例

DOI:10.12054/lydk.bisu.148
发表时间:2020

相似国自然基金

1

大小凉山彝区林木病原真菌区系研究及数据应用云平台的搭建

批准号:31860036
批准年份:2018
负责人:郑晓慧
学科分类:C0109
资助金额:40.00
项目类别:地区科学基金项目
2

种子发育相关转录因子基因家族预测和分析

批准号:31071160
批准年份:2010
负责人:罗静初
学科分类:C0608
资助金额:35.00
项目类别:面上项目
3

整合先验信息与组学数据重构转录和转录后调控网络的生物信息学方法研究

批准号:61572287
批准年份:2015
负责人:刘治平
学科分类:F0213
资助金额:63.00
项目类别:面上项目
4

一个拟南芥锌指蛋白及其互作转录因子在植物与病原细菌互作中的调控网络解析

批准号:31570249
批准年份:2015
负责人:施海涛
学科分类:C0205
资助金额:63.00
项目类别:面上项目