橡胶树分子标记的开发、遗传图谱的构建及胶乳产量相关性状的QTL定位

天然橡胶产业在我国属于典型的资源约束型产业，在国民经济和国家安全建设中具有重要的地位。海南省为主要植胶区。本研究以巴西橡胶树热研88-13、IAN873及它们的94个后代个体为研究材料，利用开发的SSR标记和AFLP标记，构建橡胶树的遗传连锁图谱。对与胶乳产量关系密切的株产干胶、干胶含量、乳管大小、乳管列数和乳管个数性状进行QTL定位，以找到与胶乳产量性状连锁的分子标记。本研究构建的高密度遗传图谱和QTL定位对提高分子标记辅助选择的效率，解决常规育种的局限性具有重要意义。

本研究主要进行了四个方面的工作，1.SSR标记的开发、筛选、鉴定及群体扫描；从NCBI上下载38815条巴西橡胶树的EST序列， 840条拼接序列含有1134个SSR重复位点，设计出721对引物，对遗传群体热研5-11×PR107进行筛选，共筛选出123对多态性引物。1139条序列含有1413个SSR重复位点，设计出687对引物。2.AFLP标记的开发筛选、鉴定及群体扫描；遗传群体热研88-13×IAN873，选用10对引物进行扩增，共扩增出875个条带，多态性条带422个；多态性条带占总条带数的48.27%；遗传群体热研5-11×PR107，选用10对引物组合对亲本及其后代进行扩增，得到773个条带，多态性条带364个。3.相关田间性状的测定：对遗传群体热研88-13×IAN873和热研5-11×PR107的重要农艺性状进行了测定、统计和分析。4、遗传图谱的构建和相关性状QTLs 的定位。构建橡胶树SSR-AFLP分子标记遗传连锁图谱包括31个连锁群，由228个SSR和AFLP标记共同组成，其中SSR标记88个，AFLP标记140个，该图谱覆盖橡胶树基因组1484.28cM，连锁群的平均长度为47.88 cM。每个连锁群包含2～66个标记，标记间的平均距离为6.51 cM。在LOD值大于2.5的条件下，检测到与株产干胶相关的QTL 3个，贡献率最大的点近rx51，可解释表型变异的47%。与干胶含量相关的QTL 4个，贡献率最大的点为rx70，可解释表型变异的41.8%,与乳管大小相关的QTL 6个，贡献率最大的点为HBE045，解释表型变异的39.5%,与乳管列数相关的QTL 1个，近rx113，可解释群体变异的26.5%。与乳管个数相关的QTL 10个，贡献率最大的点为rx81，可解释表型变异的40.9%。.研究工作取得的成果：开发橡胶树SSR标记123对，AFLP标记786个，构建了橡胶树的遗传连锁图谱；对胶乳产量相关的重要农艺性状进行了定位，检测到与株产干胶相关的QTL 3个，与干胶含量相关的QTL 4个，与乳管大小相关的QTL 6个，与乳管列数相关的QTL 1个，与乳管个数相关的QTL 10个；已发表学术论文1篇，已定稿1篇英文论文，两篇论文在准备中；培养2名博士，其中李维国博士已于2014年10月毕业，获得博士学位，另外一位博士生将于2016年毕业。