病原体-驱动平衡选择对HLA-KIR信号系统基因多样性的影响

基本信息
批准号:30900798
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:20.00
负责人:姚宇峰
学科分类:
依托单位:中国医学科学院
批准年份:2009
结题年份:2012
起止时间:2010-01-01 - 2012-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:史磊,陶玉芬,王琼,易文
关键词:
HLAKIR信号系统隔离群体病原体驱动平衡选择
结项摘要

病原体-驱动平衡选择假说认为病原体-驱动平衡选择(如感染性疾病)对HLA基因产生强大的选择力,一旦有某种等位基因突变而获得了针对病原体更强的免疫性,该突变基因频率将会增加。病原体对HLAⅠ类分子的选择压力也会转作用于HLAⅠ类分子特异受体KIR基因,使其与HLA共进化。KIR分子分布于自然杀伤细胞,它与HLAⅠ类分子结合形成HLA-KIR信号系统,保护机体抵抗不同病原体的侵袭。我们前期对一个隔离群体HLA基因的研究表明:这个隔离群体HLA基因多样性降低并形成某些HLA等位基因高频分布特征;对这个隔离群体流行病学调查显示:青壮年甲型肝炎感染率达100%。这使得这个群体成为验证病原体-驱动平衡选择压力假说的理想群体。本研究从群体角度揭示病原体-驱动平衡选择对HLA-KIR信号系统基因多样性产生和进化的影响;以期发现某些特异的HLA-KIR基因信号系统的组合在感染性疾病发生和发展过程中的作用。

项目摘要

本项目通过对一个长期隔离的汉族群体及其周边的其他汉族群体(云南汉族)HLA-KIR信号系统基因多样性的研究,我们发现:①隔离汉族与云南汉族群体HLA等位基因和单倍型分布存在较大差异,如HLA-A*0201,云南汉族的频率为0.010,而隔离汉族的频率0.086,P<0.05。HLA-B*1502,云南汉族的频率为0.044,而隔离汉族的频率高达0.124,P<0.05。单倍型A*1101:B*1502单倍型在云南汉族的频率为0.027,而隔离汉族频率为0.124,P<0.05;与云南汉族群体相比,隔离汉族的HLA基因多样性显著降低;根据HLA基因数据构建的系统发生树结果显示,隔离汉族来源于南方汉族群体,而云南汉族的HLA基因分布特征介于北方和南方汉族之间。②隔离汉族与云南汉族,无论从基因型和单倍型上看,KIR的差异都相对于HLA差异较小,隔离汉族与云南汉族的优势基因型都是基因型1(AA单倍型),频率分别为0.559和0.478。在单倍型方面,隔离汉族与云南汉族单倍型A与单倍型B的比例分别为2.91:1与2.39:1,与亚洲其他群体一致(接近3:1)。③通过HLA-KIR配体受体对分析,发现无论活化型受体配体对还是抑制性受体配体对,隔离汉族与云南汉族HLA-HLA受体配体对的差异也非常小。从本研究数据中,我们发现隔离汉族与云南汉族群体中HLA基因分布差异较大,推测可能是由于隔离汉族的起源,遗传漂变形成的HLA基因的独特型分布、多样性降低和某些等位基因的高频分布,但不排除当地环境作用(感染性疾病,特别是甲型肝炎)对HLA-KIR的影响。为确定我们的推测,我们增加其他隔离群体HLA和KIR基因分型(布朗族、哈尼族和壮族),HLA基因数据构建的系统发生树结果显示:不同群体按语系和起源聚类,而KIR基因数据构建的系统发生树结果显示:不同群体不是严格按照语系和起源聚类。结合相关报道,我们推测形成这样的原因可能是KIR基因的进化速度快于HLA基因进化速度(HLA基因进化主要来源于突变,而KIR的进化主要来源于重组),而且这种进化的原因主要是遗传漂变。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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