中国多发性硬化HLA-II类易感基因及SNP研究

目前国内外关于多发性硬化(MS)与HLA关联性研究结果不一致，而对MS患者HLA区域单核苷酸多态性(SNP)研究甚少。为此，我们对中国MS患者HLA-II类基因及其SNP进行关联研究，以期达到以下目的：1）探索MS患者HLA-II类区域新的易感基因及其相互作用；2）筛选并确定与MS关联的HLA-II类区域SNP位点，建立一种立足于标签SNP(TaqSNP)的MS基因分析方法。 我们运用PCR-SBT法对400例中国汉族MS患者及健康对照行HLA-II类基因分型，采用病例-对照及传递不平衡的策率进行关联分析；之后，基于HapMap数据库筛选TaqSNP，运用TaqMan技术对其中200例MS及对照进行SNP基因分型及关联分析，得出MS关联的SNP。最后，在另200例MS及对照中验证上述TaqSNP，分析TaqSNP在MS易感基因检查中的敏感性、特异性，及与HLA分型的相关性。

多发性硬化（MS)是一种免疫相关性中枢神经系统脱髓鞘疾病，临床表现异质。MS的亚型－视神经脊髓炎（NMO），也称为视神经脊髓型MS（OSMS）在国人较传统型MS发病率更高。研究MS易感基因，对MS高危人群预报、早期干预与预防及发病机制的理论研究有重要意义。. 本课题第一部分探讨NMO患者AQP4基因多态性与疾病易患性之间的相关性。通过收集2010年1月-2014年1月在中山大学附属第三医院神经科就诊的84例NMO患者作为研究对象，PCR扩增AQP4基因功能区，再通过与单核苷酸多态性数据库公布的中国人群AQP4基因DNA序列比较。结果共发现9个未报道的新变异位点，1个变异位于外显子2区，其余8个变异均位于基因调控区。AQP4基因功能区SNP rs3763043及rs14393，与dbSNP数据比较突变频率差异具有统计学意义。因此，我们的研究结果初步表明：（1）AQP4基因SNP与多数汉族NMO患者发病无明显相关性，但少数患者存在AQP4基因多态性改变；（2）东、西方NMO患者AQP4易患基因多态性位点不同。.本课题第二部分探讨探讨AQP4基因多态性与国人NMO临床表型的遗传相关性及分子机制。通过收集111例 NMO患者及97例NMO谱系疾病患者和204例健康对照作为研究对象，选择AQP4基因调控区的8个SNP进行基因分型，之后通过关联分析SNP基因基因型与NMO临床表型的相关性，最后利用双荧光素酶检测技术验证3'-非翻译区（3'-UTR）SNP位点的碱基改变对小分子RNA（miRNA)调控作用的影响。结果发现miRNA 323-3p对AQP4基因表达有调控作用，但3’-UTR区rs1058424碱基改变并不影响miRNA 323-3p对AQP4基因的调控。因此，AQP4基因非编码区可以对AQP4 mRNA的稳定性等进行转录后调控，进而影响AQP4的表达量以及OAP结构形成，最终影响NMO中AQP4的抗原性。. 因此本课题研究表明，AQP4基因3’-UTR区的基因多态性与NMO临床表型具有相关性。miRNA 323-3p可能通过与AQP4基因3’-UTR区某一特定位点结合起调节作用，从而参与NMO发病。本研究为开发作用于AQP4基因3’-UTR区的NMO药物治疗奠定基础。