中国蒙古族人群白癜风与HLA区域遗传相关性研究

基本信息
批准号:81160189
项目类别:地区科学基金项目
资助金额:50.00
负责人:乌日娜
学科分类:
依托单位:内蒙古医科大学
批准年份:2011
结题年份:2015
起止时间:2012-01-01 - 2015-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:韩建文,孙立,杨东生,李艳,王杰,刘玉磊,乌日嘎,于希军
关键词:
关联分析白癜风易感性HLA
结项摘要

遗传因素在白癜风的发病中都起到重要的作用。白癜风与人类白细胞抗原(HLA)的相关性早已被认可,2010年在中国人群及欧洲人群的全基因组关联分析研究发现报道的HLA区域的白癜风易感基因并不完全相同,提示不同人种见白癜风易感基因可能存在差异。课题组负责人及部分成员作为主要参与人参加了中国人群白癜风的全基因组关联分析研究。在前期研究结果基础上,本项目拟以内蒙古地区的蒙古族人群为研究对象,结合SNP分型及HLA等位基因分型方法研究HLA区域与白癜风的相关性,并进行易感变异的精细定位,构建影响蒙古族人群白癜风易感性的HLA危险单倍型,寻找真正影响疾病的易感遗传变异。该项研究将为深入理解白癜风的遗传易感性,为阐明疾病的发病机制、疾病风险预测和诊断治疗提供理论依据。

项目摘要

遗传因素在白癜风的发病中起到重要的作用。白癜风与人类白细胞抗原(HLA)的相关性早已被认可。本项目共收集蒙古族白癜风患者425例,蒙古族健康对照503例。先后对84个SNP进行基因分型,分型样本量达到928例。利用PLINK1.07软件和Haploview软件进行统计分析。主要研究内容及结果:.1、 2个位于HLA区域的SNP与蒙古族白癜风显著相关(P≤4.28E-03)。发现1个保护性单倍型(TCGT) (P = 2.80 × 10-3, OR = 0.69). 和1个危险单倍型 (CTAC) (P = 7.5 × 10-3, OR = 1.40)。4个SNP均靠近HLA-G基因,既往汉族人群中报道的白癜风相关SNP在本研究中没有显示关联性。蒙古族人群HLA易感位点可能与欧洲人群、汉族人群有所差异。.2、位于IL2RA-RBM17基因区域的5个SNP与蒙古族白癜风有显著相关。发现1个危险单倍型(CGCTA)在白癜风组频率明显低于对照组(P=0.0016,OR=0.674)。.3、CCR6基因区域的2个SNP与蒙古族白癜风显著相关。SNP rs2236313的等位基因T在病例组的频率(0.4682)高于对照组中频率(0.3976)(P= 2.24 E-03, OR=1.33)。rs6902119的等位基因C在病例组的频率(0.4623)高于对照组(0.3698)(P= 5.57E-05, OR=1.47)。2个SNP间存在强连锁不平衡。.4、在LPP基因区域2个SNP的等位基因频率在白癜风组显著低于对照组(P<0.01),二者间存在强连锁不平衡。.5、白癜风和银屑病患者血清中锌-α2-糖蛋白(ZAG)浓度均高于正常对照(P=0.042)。ZAG在白癜风、银屑病、正常对照组组织中阳性表达率差异无统计学意义。银屑病患者组织中ZAG mRNA 相对表达率明显高于对照组(2.473677),而白癜风患者组织中ZAG mRNA 相对表达率明显低于对照组(0.131437)。.本项目以蒙古族人群白癜风为研究对象,寻找影响疾病的易感遗传变异。发现一系列影响蒙古族白癜风易感性的遗传变异和单倍型。并且对锌-α2-糖蛋白在白癜风、银屑病的表达进行研究。该项目为深入理解白癜风的遗传易感性,为阐明疾病的发病机制、疾病预测以及诊断治疗提供理论依据。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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