基于表达谱数据的结构化基因功能网络分析

基本信息
批准号:30770497
项目类别:面上项目
资助金额:25.00
负责人:李园园
学科分类:
依托单位:上海市生物医药技术研究院
批准年份:2007
结题年份:2010
起止时间:2008-01-01 - 2010-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:喻辉,康斌,于复东,鲁玲伊,常啸
关键词:
基因表达谱基因功能网络选择性剪接基因芯片拓扑结构
结项摘要

基因表达谱分析的一项重要任务是发现受实验条件影响的基因功能模块。传统分析往往将表达波动的基因根据基因功能类,获得相应的基因列表。而当前基因功能知识往往以网络形式呈现,其中所蕴含的丰富的生物学知识显然不能被基因列表充分表征;同时,功能网络中的结点是蛋白质,而不是基因,前者较后者具有更丰富的多样性,因此功能知识与表达谱数据的匹配需要慎重考虑。本课题首先对知名基因芯片公司常用芯片的探针重新进行以转录本/蛋白质为中心的注释,然后将基于生物学功能网络,以细微挖掘功能知识、有机整合功能知识和基因表达谱数据为切入点,增加对基因功能网络信息的利用率,改进对基因功能网络的表达信息的概括综合,发展从基因功能网络中挖掘受基因芯片实验条件影响的"结构化基因功能模块"的算法,使表达谱数据分析结果以更符合生物学知识的功能网络形式被呈递,推进以基因功能网络为背景的基因表达研究工作的进展。

项目摘要

项目成果
{{index+1}}

{{i.achievement_title}}

{{i.achievement_title}}

DOI:{{i.doi}}
发表时间:{{i.publish_year}}

暂无此项成果

数据更新时间:2023-05-31

其他相关文献

1

基于被动变阻尼装置高层结构风振控制效果对比分析

基于被动变阻尼装置高层结构风振控制效果对比分析

DOI:10.13197/j.eeev.2019.05.95.fuwq.009
发表时间:2019
2

基于改进LinkNet的寒旱区遥感图像河流识别方法

基于改进LinkNet的寒旱区遥感图像河流识别方法

DOI:10.6041/j.issn.1000-1298.2022.07.022
发表时间:2022
3

基于文献计量学和社会网络分析的国内高血压病中医学术团队研究

基于文献计量学和社会网络分析的国内高血压病中医学术团队研究

DOI:10.11842/wst.20190724002
发表时间:2020
4

长链基因间非编码RNA 00681竞争性结合miR-16促进黑素瘤细胞侵袭和迁移

长链基因间非编码RNA 00681竞争性结合miR-16促进黑素瘤细胞侵袭和迁移

DOI:
发表时间:2021
5

血管内皮细胞线粒体动力学相关功能与心血管疾病关系的研究进展

血管内皮细胞线粒体动力学相关功能与心血管疾病关系的研究进展

DOI:10.13191/j.chj.2017.0028
发表时间:2016

李园园的其他基金

批准号:11104088
批准年份:2011
资助金额:24.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:11426106
批准年份:2014
资助金额:3.00
项目类别:数学天元基金项目
批准号:81600025
批准年份:2016
资助金额:17.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:81672736
批准年份:2016
资助金额:50.00
项目类别:面上项目
批准号:31171268
批准年份:2011
资助金额:50.00
项目类别:面上项目
批准号:51872104
批准年份:2018
资助金额:60.00
项目类别:面上项目

相似国自然基金

1

基于基因功能模块化概念的基因表达谱数据挖掘技术

批准号:30370388
批准年份:2003
负责人:郭政
学科分类:C1008
资助金额:23.00
项目类别:面上项目
2

微小隐孢子虫的基因表达谱数据分析和基因功能网络研究

批准号:30900834
批准年份:2009
负责人:于复东
学科分类:C0609
资助金额:20.00
项目类别:青年科学基金项目
3

基于GPU的基因表达谱数据特征选择策略研究

批准号:61702146
批准年份:2017
负责人:葛瑞泉
学科分类:F0213
资助金额:26.00
项目类别:青年科学基金项目
4

变应性鼻炎基因表达谱及其相关基因功能研究

批准号:30271406
批准年份:2002
负责人:章如新
学科分类:H1401
资助金额:19.00
项目类别:面上项目