心肌梗死中microRNA和转录因子前馈环调控网络及验证

基本信息
批准号:31171271
项目类别:面上项目
资助金额:60.00
负责人:郭安源
学科分类:
依托单位:华中科技大学
批准年份:2011
结题年份:2015
起止时间:2012-01-01 - 2015-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:席姣娅,徐承启,龚静,叶华山,刘辉,马兆武,张红梅,刘伟
关键词:
共调控模块靶基因预测转录因子心肌梗死microRNA
结项摘要

心肌梗死是威胁人类生命的严重疾病和受多因素影响的复杂疾病,其具体病理机制还有待进一步研究。转录因子(TF)和miRNA都是在复杂疾病中起重要作用的调节因子,但其共调控的研究较少。本项目在前期工作基础上,首先拟整合多种预测方法和实验数据预测miRNA和TF的靶基因,系统构建全基因组水平的miRNA-TF-靶基因共调控前馈环模块。然后结合我们已构建的心肌梗死基因数据库和miRNA相关SNP数据库,系统分析心肌梗死中的miRNA-TF共调控模块和网络以及miRNA相关SNP对该调控网络的影响,预测心肌梗死中重要的miRNA-TF共调控模块和调节因子。最后通过实验验证核心调控模块的存在,并在心肌细胞和心肌梗死动物模型中分析核心调控模块和调节因子的作用。本项目为揭示心肌梗死发病的调控机理并寻找潜在生物靶标提供理论基础,具有重要的应用价值,也为复杂疾病的研究提供新的交叉研究思路,具有重要的学术意义。

项目摘要

心肌梗死是世界范围内的一大导致人类死亡的主要疾病,针对心肌梗死的大量研究包括全基因组关联分析等发现了许多心肌梗死相关的基因。然而这些基因间的调控机制和调控网络尚不清楚。申请人通过收集心肌梗死相关的基因和miRNA,构建心肌梗死的转录因子和miRNA共调控网络,并通过统计检验和子网络分析验证了该网络与心肌梗死的关系,预测了一些核心调控因子的重要功能。同时我们发现网络中的很多预测调控关系可以作为桥梁串联以前的一些文献结果,如miR-29在介导纤维化、血管生成和细胞凋亡中都参与调控。进一步针对心肌梗死复发与未复发病人的表达数据,我们筛选了差异基因,构建了可能与心肌梗死复发相关的转录因子和miRNA调控网络。对该复发相关调控的分析发现了一些可能作为心梗复发标志的调控模块和基因,如MAX/miR-320a/BMP6调控模块。最后我们基于这些分析和已有的知识,构建了一个心肌梗死相关的调控网络的细胞模型,列出了其中重要的基因和调控因子及其调控关系。这些研究为心肌梗死的疾病进展和复发提供了新的调控机制并且联系和解释了以前的一些零散实验结果,为深入了解心肌梗死提供新的视角。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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