生物大分子晶体衍射数据收集和相位求解新技术和新方法研究

基本信息
批准号:31270795
项目类别:面上项目
资助金额:15.00
负责人:刘志杰
学科分类:
依托单位:中国科学院生物物理研究所
批准年份:2012
结题年份:2013
起止时间:2013-01-01 - 2013-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:丁玮,牛锋锋,华甜
关键词:
衍射数据收集晶体结构相位解析
结项摘要

Protein crystallography is one of the core components of structural biology. The methodology and technology study is the driven force of structural biology. Targeting at "diffraction data collection" and "phasing", the key problems in protein crystallography, we focus our study on the following areas through innovation and integration: 1) In order to improve the accuracy of data collection, study and perfect the application of MDS(Multi-DataSet) data collection method; 2) study the sulfur phasing method (S-SAD) and make it more applicable to more general structure determination experiments; 3) Perform in depth study on the "Parameter Space Screening" method proposed by the applicant, construct a more automatic and more efficient structure determination pipeline, make it more suitable for S-SAD phasing. Through integrating the research results proposed above, we would like to construct a virtual toolbox for the structural biologists who may access this toolbox remotely via internet. This toolbox contains the MDS data collection expert system which can provide the users with the optimal values of data collection parameters. The toolbox also provides users the remote structure determination pipeline based on the parameter space screening method. This pipeline will significantly increase the structure determination efficiency and success rate.

蛋白质晶体学是结构生物学的重要组成部分,蛋白质晶体学中的新技术和新方法研究是推动结构生物学发展的核心动力。本课题针对蛋白质晶体学中的核心问题 - 数据收集和相位求解,拟通过创新和整合进行如下三方面的研究:1)为提高衍射数据收集精度,研究和完善基于多重数据收集理论的新型数据收集的MDS方法;2)研究基于硫原子反常散射信号的单波长反常散射相位法(S-SAD),使之更适于常规晶体的结构测定;3)深入研究由申请人提出的"参数空间筛选"方法,构建一个自动化程度和结构解析效率更高、更适于S-SAD的结构解析流水线。本课题将整合上述研究成果,构建一个包含MDS数据收集专家系统、适于S-SAD和一般相位求解的高通量结构解析远程服务平台。通过提供MDS数据收集最佳参数、提高结构解析成功率而有效缓解蛋白质结构解析中的瓶颈问题。为我国结构生物学家提供远程和开放的数据收集和结构解析服务环境。

项目摘要

蛋白质晶体学是结构生物学的重要组成部分,蛋白质晶体学中的新技术和新方法研究是推动结构生物学发展的核心动力。本课题针对蛋白质晶体学中的核心问题 - 数据收集和相位求解,通过整合各项研究成果,构建了一个包含MDS数据收集专家系统、适于S-SAD和一般相位求解的高通量结构解析远程服务平台。通过提供MDS数据收集最佳参数、提高结构解析成功率而有效缓解蛋白质结构解析中的瓶颈问题。为我国结构生物学家提供远程和开放的数据收集和结构解析服务环境。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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